BMB207: Biophotonics (5 ECTS)

STADS: 01015201

Niveau
PhD-kursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: brewer@memphys.sdu.dk

Skemaoplysninger
Der er ingen skemaoplysninger for den valgte periode.

Kommentar:
Max deltagerantal: 16. Kurset kører i januar. Kurset er et ph.d.-kursus. Kandidatstuderende kan tage kurset iflg. forudgående aftale med underviser. Afholdes i januar 2018.

Indgangskrav:
Kandidatuddannelse i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, biomedicin, medicin eller nanobioscience.

Faglige forudsætninger:
Ingen

Formål
Målet med kurset er at lære de studerende generelle principper for fluorescens og lysmikroskopi samt principperne bag avancerede fluorescens og billeddannende teknikker samt en kort introduktion til billedbehandling.  Der vil være praktiske demonstrationer og lab øvelser for alle emner. Kurset er en fem dages intensivt kursus, der finder sted inden for en uge.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give kompetence til at identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
  • Give færdigheder i udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering
  • Give viden om styrkerne og begrænsningerne af moderne teknikker i mikroskopi 

 



Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
  • Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
  • Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
  • Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
  • Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
  • Præsentere videnskabelige resultater i et mundtligt seminar på engelsk.
  • Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur
 


Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Wide field microscopy
  • Laser scanning single-photon confocal microscopy
  • Two-photon microscopy
  • Spinning disk confocal microscopy
  • Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS)
  • Raster Image Correlation Spectroscopy (RICS)
  • Fluorescent Lifetime Imaging microscopy (FLIM)
  • kICS/PALM (k‐Space Image Correlation Spectroscopy/ photoactivated localization microscopy) 
  • Coherent anti Raman scattering microscopy (CARS) 
  • Stimulation emission depletion microscopy (STED)
  • Introduction to image analyses using FIJI and Huygens.
  •  


Litteratur
Der er i øjeblikket ikke angivet nogle materialer for kurset.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
  1. Deltagelse i alle forelæsninger, Laboratorieøvelse og eksaminatorier timer. Bestået/ikke-bestået, intern censur ved underviser. (01015212).
Eksamen- og censurform:
  1. Mundtlig eksamen, intern bedømmelse ved underviser, bestået/ikke bestået. Nærmere beskrivelse af eksamensreglerne vil blive offentliggjort under 'Course Information' på kursets side i Blackboard.(5 ECTS). (01015202).
Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 12 timer
Træningsfase: 29 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 8 timer
 - Laboratorieøvelser: 21 timer

Aktiviteter i studiefasen
  • Læsning af pensum
  • Udarbejdelse af opgave i selvstændige og i grupper
 
Undervisningsform

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Bemærkninger
Kurset kan ikke tages hvis man allerede har taget BMB825. 

Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:
  1. Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen har første prioritet
  2. Studerende, der er optaget betinget på kandidatuddannelsen har hernæst prioritet
  3. Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
  4. Bachelorstuderende
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 4, trækkes der lod.
 
Fagmiljøerne på Det naturvidenskabelige Institut forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.

Forudsætningen for at beholde pladsen på kurset er personligt fremmøde første kursusdag eller på anden måde underretning til underviseren. Ved manglende fremmøde eller underretning i øvrigt optages kursuspladsen af studerende fra ventelisten, i den rækkefølge ventelisten angiver. 
 


Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2018 til 31. januar 2019.