BMB513: Bioinformatik II (5 ECTS)

STADS: 01001301

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
2. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: gary@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB511 Bioinformatik I, DM502 Programmering A & DM503 Programmering B skal være bestået.

Kursusintroduktion
Kurset vil introducere nye emner samt bygge videre på emner gennemgået i Bioinformatik I. Der vil være fokus på de praktiske aspekter af bioinformatikken, som har relevans Bioteknologi/Drug discovery industrien som forberedelse til en karriere inden for dette felt.

Kompetencer
Viden om nutidige industrielle teknologier og tendenser, som relaterer til bioinformatikområdet. Viden om den matematiske baggrund for de bioinformatikværktøjer, der hyppigt benyttes af forskere (f.eks. alignment algoritmer) samt praktisk erfaring med nogle af disse værktøjer. Viden og praktisk erfaring, som forberedelse til en beskæftigelse som bioinformatiker. Viden og praktisk erfaring der vil give den studerende bedre muligheder for at træde ind i et job som bioinformatiker.

Forventet læringsudbytte


Emneoversigt
Matematisk og statistisk analyse (Hidden Markov Models, Neural Networks, Sequence Alignment and Pattern Matching in DNA and proteins, associated algorithms), database systemer i biologi (design, data integration, data mining), modeller (metabolomics, cellular process dynamics, protein/chemical structure modeling), kendte metoder (phylogenetic analysis, protein structure), and kromosom analyser (cDNA arrays/RNA profiling, normalization, cluster analysis, pathway analysis, SNPs).

Litteratur

• oplyses senere.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Projektopgave med intern censur ved 2 undervisere. Karakterer efter 7-skalaen.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Eksaminatorietimer/opgaveregning 30 timer. Laboratorieøvelser 20 timer.
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2006 til 31. januar 2009.