BMB825: Bioimaging (5 ECTS)

STADS: 01015501

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: brewer@memphys.sdu.dk

Yderligere undervisere
wuestner@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Mandag 10-12 U17 17
Fælles I Mandag 10-12 U141 20
Fælles I Tirsdag 08-10 U17 16
Fælles I Tirsdag 08-10 U142 19-20
Fælles I Tirsdag 08-10 U155 21
Fælles I Onsdag 08-10 U17 17
Fælles I Torsdag 10-12 U142 18
Fælles I Torsdag 08-10 U23A 21
Fælles I Fredag 12-14 U17 16
Fælles I Fredag 12-14 U142 19
H1 TL Mandag 14-18 *Odense Lokalitet aftales 13 19 DamBIC
H1 TL Mandag 12-16 *Odense Lokalitet aftales 13 20 DamBIC
H1 TL Mandag 10-14 *Odense Lokalitet aftales 11 22 DamBIC
H1 TE Tirsdag 10-12 U17 17
H1 TL Tirsdag 10-14 *Odense Lokalitet aftales 13 18-20 DamBIC
H1 TL Tirsdag 14-16 *Odense Lokalitet aftales 11 19
H1 TL Tirsdag 10-14 *Odense Lokalitet aftales 11 21-22 DamBIC
H1 TL Onsdag 08-12 *Odense Lokalitet aftales 13 18 DamBIC
H1 TL Onsdag 12-16 *Odense Lokalitet aftales 11 21 DamBIC
H1 TE Onsdag 08-10 U155 21
H1 TE Torsdag 10-12 U142 20
H1 TE Fredag 12-14 U142 18
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
MAX 12 studerende

Indgangskrav:
Bacheloruddannelsen i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, nanobioscience eller biomedicin.

Faglige forudsætninger:
Det anbefales at de studerende har fulgt og bestået kurset BMB509 eller lignende.

Formål
Bioimaging spiller en vigtig rolle i moderne biovidenskab, som et redskab til forskning, men også til at forbedre medicinske behandlinger og menneskeliv. Faget bioimaging indebærer teknikker til at udforske biologiske struktur og funktion, og visualisere/analysere disse oplysninger i tre og fire dimensioner.

På dette kursus vil den studerende blive introduceret til de grundlæggende principper for optisk bioimaging samt til avancerede state-of-the-art teknikker. Kurset vil introducere den teoretiske baggrund, men er fokuseret på hands-on eksperimenter i laboratoriet. De studerende vil blive introduceret til mange forskellige optiske bioimaging teknikker og vil få de nødvendige redskaber til at lave præcis kvantitativ bioimaging. De vil også blive undervist i styrkerne og begrænsningerne af de forskellige teknikker. Kurset vil således samlet give de studerende en værktøjskasse til selvstændigt at anvende relevante optiske bioimaging teknikker

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give kompetence til at identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
  • Give færdigheder i at udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering
  • Give viden om styrkerne og begrænsningerne af moderne teknikker i mikroskopi 

 



Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
  • Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
  • Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
  • Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
  • Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
  • Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur
 


Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Wide field microscopy
  • Laser scanning single-photon confocal microscopy
  • Two-photon microscopy
  • Spinning disk confocal microscopy
  • Fluorescence Correlation Spectroscopy
  • Raster Image Correlation Spectroscopy
  • Atomic Force microscopy
  • Fluorescent Lifetime Imaging microscopy
  • Introduktion til billedbehandling med FIJI og Huygens
 


Litteratur
Der er i øjeblikket ikke angivet nogle materialer for kurset.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
  1. Deltagelse i alle Laboratorieøvelse, Bestået/ikke-bestået, intern censur ved underviser. Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a). (01015522).

     

Eksamen- og censurform:
  1. Godkendelse af rapporter, intern bedømmelse ved underviser, bestået/ikke, bestået. (1 ECTS), alle hjælpemidler tilladt. (01015512).
  2. Mundtlig eksamen, karakter efter 7-trinsskalen, intern censur, (4 ECTS). Ingen hjælpemidler tilladt. (01015502).
Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 24 timer
Træningsfase: 24 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 4 timer
 - Laboratorieøvelser: 20 timer

Aktiviteter i studiefasen
  • Læsning af pensum
  • Udarbejdelse af opgaver i selvstændige og i grupper.
Undervisningsform
The intro phase consists of lectures which provide an introduction to the course. Students are expected to independently read prescribed texts to achieve the expected competencies and necessary overview.

The skills training phase deals with the central parts of the course using computer based exercises and hands on microscopy laboratory training. The lab exercises in which students work together in small groups of 2-3 people give a practical implantation of the theory presented in the intro phase.

The study phase is partly preparation for the intro lectures, tutorials and laboratory exercises as well as preparation of laboratory reports and exam preparation (repetition).

Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.

Bemærkninger
Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:
  1. Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen har første prioritet
  2. Studerende, der er optaget betinget på kandidatuddannelsen har hernæst prioritet
  3. Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
  4. Bachelorstuderende
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 4, trækkes der lod.
 
De faglige miljøer på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.

Forudsætningen for at beholde pladsen på kurset er personligt fremmøde første kursusdag eller på anden måde underretning til underviseren. Ved manglende fremmøde eller underretning i øvrigt optages kursuspladsen af studerende fra ventelisten, i den rækkefølge ventelisten angiver. 
 


Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2017 til 31. januar 2019.