DM832: Kemoinformatik (5 ECTS)

STADS: 15013301

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
Udbydes efter behov

Ansvarlige undervisere
Email: daniel@imada.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Ubegrænset deltagerantal. 1. kvartal.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Kendskab til algoritmer, datastrukturer og kompleksitet, svarende til f.eks. fra DM507 og DM508. Stoffet fra DM515 Introduktion til lineær og heltalsprogrammering og DM517 Beregnelighed skal være kendt.

Kursusintroduktion
Kemoinformatik er et forskningsområde, der kombinerer metoder fra datalogi og kemi med henblik på at løse kemiske problemer effektivt. Kurset vil give den nødvendige teoretiske baggrund for at løse sådanne problemer. Deltagerne vil lære at anvende disse metoder, med henblik på at undersøge komplekse interaktioner i kemiske og biologiske systemer og på at opdage nye emergente egenskaber som følger af den systemiske synspunkt.

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:

• anvende og forklare metoder, modeller og algoritmiske ideer dækket i kurset,
• formulere ovenstående i præcist sprog og notation,
• implementere algoritmer og datastrukturer fra kurset,
• beskrive implementeringen og det eksperimentelle arbejde i et klart og præcist sprog, og på en struktureret måde.

Emneoversigt

• repræsentation af molekylære strukturer
• struktur deskriptorer
• artificial chemistries
• graf grammatikker
• støkiometriske modeller
• metaboliske netværk og stofskifteveje
• flux balance analyse
• organisationsteori
• Petri nets

Litteratur

Meddeles ved kursets start.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:

1. Obligatoriske opgaver. Bedømmes med bestået/ikke bestået, intern bedømmelse ved underviser.
2. Mundtlig eksamen. Bedømmes efter 7-trinsskalaen, ekstern censur, 5 ECTS

Obligatoriske opgaver skal være bestået for at man kan deltage i den mundtlige eksamen. De afleverede opgaver gælder til og med reeksamen og kan således ikke overføres til det efterfølgende år.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 28 timer
Træningsfase: 14 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 14 timer

Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.

Bemærkninger
Kurset er placeret i efterårssemesteret. Kurset udbydes efter behov.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Dette er den nyeste version af en kursusbeskrivelse, som trådte i kraft den 1. sep 2012.