DM840: Algoritmer i kemoinformatik (10 ECTS)
STADS: 15015401Niveau
Kandidatkursus
Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
Ansvarlige undervisere
Email: daniel@imada.sdu.dkSkemaoplysninger
| Hold | Type | Dag | Tidsrum | Lokale | Uger | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Fælles | I | Mandag | 14-16 | IMADA Seminarrum | 36,37,38,39,40,41,43,44,45,46,47,48,49,50,51 | |
| Fælles | I | Tirsdag | 12-14 | IMADA Seminarrum | 38,40,43,45,47,49 | |
| Fælles | I | Torsdag | 10-12 | IMADA Seminarrum | 36,37,38,39,40,41,43,44,45,46,48,49,50,51 | |
| Fælles | I | Torsdag | 10-12 | U145 | 43 | |
| Fælles | I | Torsdag | 10-12 | U71 | 44 | |
| Fælles | I | Torsdag | 10-12 | Spørg underviseren | 47,47 |
Vis personligt skema for dette kursus.
Kommentar:
Ubegrænset deltagerantal.
Indgangskrav:
Ingen
Faglige forudsætninger:
DM508 Algoritmer og kompleksitet, DM545 Lineær og heltalsprogrammering (old DM515), DM517 Beregnelighed, MM505 Linieær algebra anbefales at være kendt.
Kursusintroduktion
Kemoinformatik er et forskningsområde, der
kombinerer metoder fra datalogi og kemi med henblik på at løse kemiske problemer effektivt. Kurset vil give den nødvendige teoretiske
baggrund og algoritmer for at løse sådanne problemer. Deltagerne vil
lære at anvende disse metoder, med henblik på at undersøge komplekse
interaktioner i kemiske og biologiske systemer, og på at opdage nye
egenskaber der frekommer som følge af den systemiske synsvinkel.
Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
- anvende og forklare metoder, modeller og algoritmiske ideer dækket i kurset,
- formulere ovenstående i præcist sprog og notation,
- implementere algoritmer og datastrukturer fra kurset,
- beskrive implementeringen og det eksperimentelle arbejde i et klart og præcist sprog, og på en struktureret måde.
- repræsentation af molekylære strukturer
- struktur deskriptorer
- grafisomorfiproblemer
- Pólyas tælleteori
- kunstige kemier (artificial chemistries)
- graf-grammatikker
- støkiometriske modeller
- metaboliske netværk og stofskifteveje
- flux balance analyse
- organisationsteori
- Petri nets
- Meddeles ved kursets start.
Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).
Forudsætningsprøver
Ingen
Eksamen- og censurform:
- Obligatoriske opgaver. Bedømmes med bestået/ikke bestået, intern
bedømmelse ved underviser. (15015412) - Mundtlig eksamen. Bedømmes efter 7-trinsskalaen, ekstern censur (10 ECTS). (15015402)
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 42 timer
Træningsfase: 28 timer, heraf:
- Eksaminatorie: 28 timer
Aktiviteter i studiefasen
Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.
Bemærkninger
Obligatoriske opgaver skal være bestået for at man kan deltage i den
mundtlige eksamen. De afleverede opgaver gælder til og med reeksamen
og kan således ikke overføres til det efterfølgende år.
Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.
Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.
Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2014 til 31. januar 2016.
