BB829: Akvatisk Geomikrobiologi (10 ECTS)

STADS: 04008601

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. og 4. kvartal

Ansvarlige undervisere
Email: dec@biology.sdu.dk

Yderligere undervisere
khabicht@biology.sdu.dk
loretodb@biology.sdu.dk
sacrowe@biology.sdu.dk
verona@biology.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Bachelorgrad i biologi, kemi eller geologi.

Kursusintroduktion


Kompetencer
Kurset vil give en indgående forståelse af mikroorganismers rolle i grundstoffernes kredsløb i akvatiske miljøer og kurset introducerer såvel forskellige metoder til at kvantificere denne rolle som metoder til at bestemme mikroorganismers diversitet i naturlige miljøer.

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
• Beskrive de mest brugte fylogenetiske klassifikationsskemaer og forklare de evolutionære forbindelser imellem de vigtigste grupper.
• Forklare gentransportens betydning for mikroorganismernes fylogeni i naturen.
• Diskutere hvilke metoder der bruges til bestemmelse af mikrobiel diversitet og forklare de forskellige faktorer som har betydning for diversitet.
• Diskutere hvordan energien begrænsede livet på Jorden før der kom ilt, og hvilken betydning ilten har haft på udvikling af liv.
• Forklare den anaerobe kulstoffødekæde.
• Diskutere det biogeokemiske kredsløb af ilt, kulstof, kvælstof, svovl, jern og mangan.
• Beskrive hvordan mikroorganismer ved både at udnytte og danne kemiske gradienter er i stand til at gro.
• Anvende simple diffusionsmodeller til at kvantificere iltforbruget i naturlige systemer.
• Forklare metoderne som bruges til at kvantificere de vigtigste kultstof nedbrydende processer.
• Diskuter principperne bag mikrobielle batterier.
• Diskutere fraktioneringen af svovl, kulstof og kvælstof i naturen og bruge disse fraktioneringer til at skelne de vigtigste mikrobielle processer i naturen.

Emneoversigt
a. Mikrobiel evolution, systematik og Fylogeni.
b. Mikrobiel diversitet.
c. Molekylær økologiske teknikker.
d. Mikrobielle dyrkningsformer.
e. Mikroorganismernes rolle i at kontrollere grundstoffernes cyklus især ilt, kulstof, jern, svovl, mangan og kvælstof.
f. Modellering af mikrobielle processer.
g. Livet før forekomsten af ilt, det tidligste liv på Jorden.

Litteratur

• Canfield, D., Kristensen, E. and Thamdrup, B: Aquatic Geomicrobiology, Academic Press, 2005.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
a) Laboratorieøvelser, bestået/ikke-bestået og intern censur ved underviser. (04008612)
b) 4 timers skriftlig eksamen med ekstern censur og karakter efter 7-trins skalaen.(04008602)

Reeksamen i umiddelbar forlængelse af kurset i 4. kvartal

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger: 28 timer
Laboratorieøvelser: 70 timer
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2010 til 31. august 2013.