BB833: Marin mikrobiologi (5 ECTS)

STADS: 04009801

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
2. kvartal

Ansvarlige undervisere
Email: khabicht@biology.sdu.dk

Yderligere undervisere
atreusch@biology.sdu.dk
rnglud@biology.sdu.dk

Skemaoplysninger
Der er ingen skemaoplysninger for den valgte periode.

Kommentar:
Kurset er aflyst efteråret 2011 p.g.a. for få tilmeldinger.

Kurset undervises på engelsk

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Bachelorgrad i Biologi eller tilsvarende.
Studerende, som har bestået BB829 Akvatisk geomikrobiologi kan ikke tage dette kursus.

Kursusintroduktion
Kurset vil give en indgående forståelse af mikroorganismers rolle i forskellige marine miljøer med fokus på disses rolle i kulstof- og næringsstofkredsløb. Kurset vil introducere metoder til at kvantificere denne rolle inklusiv metoder til vurdering af mikroorganismers udbredelse, diversitet og funktion.

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:

• Beskrive nogle af de vigtigste marine mikroorganismer.
• Diskutere brugen af geonomic og metagenomic i marine miljøer.
• Bruge og diskutere forskellige metoder til at identificere og kvantificere marine mikroorganismer.
• Diskutere picoplanktonets rolle i marine miljøer.
• Diskutere mikroorganismernes rolle i havets pelagiske kulstofkredsløb.
• Diskutere metoder til at kvantificere primærproduktion i marine miljøer.
• Bruge og beskrive forskellige metoder til at kvantificere kulstof-nedbrydning i det pelagiske miljø.
• Diskutere betydningen af mikroorganismer i omsætningen af bioaktive grundstoffer i det pelagiske miljø, med fokus på C, S, P og N kredsløb.
• Diskutere betydningen af sedimentet for udveksling af bioaktive stoffer med vandsøjlen og være i stand til at kvantificere disse fluxe.
• Diskutere udviklingen, den mikrobielle økologi og biogeokemien i iltminimums zoner i verdenshavet.
• Beskrive forskellige ekstreme marine miljøer.

Emneoversigt

1. Bakterier og Archaea i marine miljøer og forskellige molekylær økologiske teknikker til at identificere disse.
2. Genomics og metagenomics af marine prokaryoter.
3. Økologi og diversitet hos picoeukaryoter.
4. Primærproducerende mikroorganismer og metoder til at kvantificere primærproduktion i havet.
5. Havets kulstofkredsløb og kvantificering af de vigtigste processer.
6. Mikroorganismers rolle for kontrol af omsætning af bioaktive grundstoffer som ilt, kvælstof, fosfor og svovl i det pelagiske miljø .
7. Vand-sediment interfacen og metoder til at kvantificere flux af bioaktive forbindelser.
8. Betydning af ilt minimums zoner i det pelagiske miljø.
9. Ekstreme marine miljøer.

Litteratur

• Kirchman, David L: Microbial Ecology of the Ocean , 2nd edition, Wiley- Blackwell, 2008.
• Kompendium til Marine Microbiology , 2011.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
a) Laboratorieøvelser, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser (1 ECTS). (04009812)
b) Skriftlig eksamen, 7-trinsskalaen, ekstern censur (4 ECTS). (04009802)

Reeksamen efter 4. kvartal.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger, antal timer: 14
Eksaminatorietimer: 14
Laboratorieøvelser, antal timer: 28
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Bemærkninger
Kurset erstatter BB829 Akvatisk Gemokrobiologi.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2011 til 31. august 2012.