BMB501: Biomolekylær Kemi (5 ECTS)

STADS: 01000101

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: f.kir@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
ebp@ifk.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Skemaændringer:
j. F Y: Skemaændringer S6 efter ønske.
j. F Y: Hold S6 flyttet fredage i ugerne 09-11 efter ønske.
j. F Y: Forelæsning samt S1 og S9 flyttet onsdag uge 9.
j. F Y: S8 og S18 er sammenlagt i BMB501 lab i uge 9.

Kommentar:
I umiddelbar forlængelse af forelæsningen i BMB501 i U55 vil repræsentanter fra de forskellige institutter guide jer videre til de forskellige mødesteder.:

BIOMEDICIN BIOKEMI & MOLEKYLÆR BIOLOGI:
(Opsamling I U55 eller mødested BMB´s seminarrum)
MATEMATIK ANVENDT MATEMATIK
(Mødested U49B)
FYSIK
(Opsamling I U55 eller mødested i MEMPHYS common room)
NANOBIOSCIENCE
(Mødested: Foran U55)
KEMI
(Opsamling I U55 eller mødested: Spektroskopilokalet)


Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Stoffet fra KE501 Kemi 1 - Grundlæggende Kemi samt BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem eller BB508 – Dyre- og plantebiologi forudsættes kendt.
Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået BM102.

Kursusintroduktion
Målsætningen er at give den studerende en forståelse af biomolekyler i både en kemisk og en biologisk sammenhæng. Dette gøres ved

• At introducere de centrale typer af biologiske makromolekyler; proteiner, nukleinsyrer, lipider og kulhydrater.

• At give en forståelse af, at grundlæggende organisk kemi definerer disse biologiske makromolekylers struktur og dermed deres funktion.

• At illustrere, at funktionen af biologiske makromolekyler (ofte) er af grundlæggende organisk-kemisk natur.



Kompetencer
• Kunne vurdere grundlæggende kemiske egenskabers betydning for et biomolekyles struktur

• Have en fundamental forståelse af sammenhænget mellem et biomolekyles struktur og dets funktion.

• Kendskab til kemisk syntese af biomolekyler og til biomolekylers kemiske reaktioner.

• Grundlæggende færdigheder i et biokemisk laboratorium, herunder håndtering af mikroliter volumener, udførelse af laboratorieøvelser på basis af skriftlig vejledning, reproduktion af forsøgsserier.

Forventet læringsudbytte
Når kurset teoridel er bestået, forventes den studerende at kunne:

• Angive og skitsere mekanismen for de non-kovalente kræfter, der virker i biomolekyler.
• Diskutere de fire strukturniveauer i proteiner.
• Forklare hydrofobe og hydrofile egenskabers betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Forklare steriske effekters betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Skitsere og give eksempler på sammenhænget mellem biomolekylers struktur og funktion.
• Gengive grundstrukturen i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Navngive de funktionelle grupper i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Navngive heterocykliske ringe.
• Opskrive de almindelige kemiske og enzymatiske reaktioner for ovennævnte funktionelle grupper og heterocykliske ringe.
• Kende principperne i laboratoriesyntese af nukleinsyrer og peptider.
• Anvende stereokemisk nomenklatur på biomolekyler.
• Opskrive biomolekyler og heterocykliske forbindelser ved forskellige pH-værdier

Når kurset laboratoriedel er bestået, forventes den studerende at:

• Kunne håndtere en justerbar automatpipette på reproducerbar vis.
• Lave fortyndingsserier samt måle disse spektrofotometrisk.
• Kende til gelelektroforese.
• Kunne skitsere principperne i spektrofotometrisk måling, og kende til spektrofotometrets anvendelse i studiet af biokemiske reaktioner.
• Kende til brugen af standardkurver.• Kunne udføre en enzymatisk syntese.
• Kende til måling af stoffers optiske renhed.

Emneoversigt
1. Kulhydrater:

• Monosakkarider og deres stereokemi
• Disakkarider
• Polysakkarider og deres biologisk forskelle.
  
  

2. Nukleinsyrer

• Nukleosider og heterocyklisk kemi, inkl. tautomeri
• Nukleotider
• Oligonukleotider og deres syntese
• DNA/RNA struktur
  
  

3. Peptider

• Aminosyrer og deres organiske kemi
• Peptider; deres syntese og strukturelle egenskaber
• Proteiners struktur og funktion
• Protein–nukleinsyre genkendelse
  
  

4. Lipider

• Struktur
• Hydrofobe og hydrofile egenskaber
• Lipider og proteiner i membraner

Litteratur

• Kirpekar & Pedersen: Biomolecular Chemistry, 3rd edition., Pearson Custom Publishing. Kan købes i Studenterboghandelen .

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
(a) Godkendelse af laboratorieresultater, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser; laboratorieøvelserne vægtes med 1 ECTS ud af kursets 5 ECTS (01000112).
(b) 4 timers skriftlig eksamen med alle hjælpemidler, undtagen enhver form for kommunikation med andre personer. Eksamensbesvarelsen skal afleveres fuldstændigt i elektroniske form, uploaded til en nærmere angiven adresse. Karakter efter 7-trins skala, ekstern censur (01000102).

Reeksamen efter 4. kvartal.

Eksamensdato
Den ordinære eksamen finder sted den 29. marts 2012
Reeksamen finder sted den 20. august 2012

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatorisk laboratorieøvelser (12 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. February 2012 til 31. August 2013.