BMB501: Biomolekylær Kemi (5 ECTS)

STADS: 01000101

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: f.kir@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
ebp@ifk.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Skemaændringer:
: Skemaændringer S6 efter ønske.
: Hold S6 flyttet fredage i ugerne 09-11 efter ønske.
: Forelæsning samt S1 og S9 flyttet onsdag uge 9.
: S8 og S18 er sammenlagt i BMB501 lab i uge 9.

Kommentar:
I umiddelbar forlængelse af forelæsningen i BMB501 i U55 vil repræsentanter fra de forskellige institutter guide jer videre til de forskellige mødesteder.:

BIOMEDICIN BIOKEMI & MOLEKYLÆR BIOLOGI:
(Opsamling I U55 eller mødested BMB´s seminarrum)
MATEMATIK ANVENDT MATEMATIK
(Mødested U49B)
FYSIK
(Opsamling I U55 eller mødested i MEMPHYS common room)
NANOBIOSCIENCE
(Mødested: Foran U55)
KEMI
(Opsamling I U55 eller mødested: Spektroskopilokalet)


Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Stoffet fra KE501 Kemi 1 - Grundlæggende Kemi samt BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem eller BB508 – Dyre- og plantebiologi forudsættes kendt.
Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået BM102.

Kursusintroduktion
Målsætningen er at give den studerende en forståelse af biomolekyler i både en kemisk og en biologisk sammenhæng. Dette gøres ved

• At introducere de centrale typer af biologiske makromolekyler; proteiner, nukleinsyrer, lipider og kulhydrater.

• At give en forståelse af, at grundlæggende organisk kemi definerer disse biologiske makromolekylers struktur og dermed deres funktion.

• At illustrere, at funktionen af biologiske makromolekyler (ofte) er af grundlæggende organisk-kemisk natur.



Kompetencer
• Kunne vurdere grundlæggende kemiske egenskabers betydning for et biomolekyles struktur

• Have en fundamental forståelse af sammenhænget mellem et biomolekyles struktur og dets funktion.

• Kendskab til kemisk syntese af biomolekyler og til biomolekylers kemiske reaktioner.

• Grundlæggende færdigheder i et biokemisk laboratorium, herunder håndtering af mikroliter volumener, udførelse af laboratorieøvelser på basis af skriftlig vejledning, reproduktion af forsøgsserier.

Forventet læringsudbytte
Når kurset teoridel er bestået, forventes den studerende at kunne:

• Angive og skitsere mekanismen for de non-kovalente kræfter, der virker i biomolekyler.
• Diskutere de fire strukturniveauer i proteiner.
• Forklare hydrofobe og hydrofile egenskabers betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Forklare steriske effekters betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Skitsere og give eksempler på sammenhænget mellem biomolekylers struktur og funktion.
• Gengive grundstrukturen i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Navngive de funktionelle grupper i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Navngive heterocykliske ringe.
• Opskrive de almindelige kemiske og enzymatiske reaktioner for ovennævnte funktionelle grupper og heterocykliske ringe.
• Kende principperne i laboratoriesyntese af nukleinsyrer og peptider.
• Anvende stereokemisk nomenklatur på biomolekyler.
• Opskrive biomolekyler og heterocykliske forbindelser ved forskellige pH-værdier

Når kurset laboratoriedel er bestået, forventes den studerende at:

• Kunne håndtere en justerbar automatpipette på reproducerbar vis.
• Lave fortyndingsserier samt måle disse spektrofotometrisk.
• Kende til gelelektroforese.
• Kunne skitsere principperne i spektrofotometrisk måling, og kende til spektrofotometrets anvendelse i studiet af biokemiske reaktioner.
• Kende til brugen af standardkurver.• Kunne udføre en enzymatisk syntese.
• Kende til måling af stoffers optiske renhed.

Emneoversigt
1. Kulhydrater:

• Monosakkarider og deres stereokemi
• Disakkarider
• Polysakkarider og deres biologisk forskelle.
  
  

2. Nukleinsyrer

• Nukleosider og heterocyklisk kemi, inkl. tautomeri
• Nukleotider
• Oligonukleotider og deres syntese
• DNA/RNA struktur
  
  

3. Peptider

• Aminosyrer og deres organiske kemi
• Peptider; deres syntese og strukturelle egenskaber
• Proteiners struktur og funktion
• Protein–nukleinsyre genkendelse
  
  

4. Lipider

• Struktur
• Hydrofobe og hydrofile egenskaber
• Lipider og proteiner i membraner

Litteratur

• Kirpekar & Pedersen: Biomolecular Chemistry, 3rd edition., Pearson Custom Publishing. Kan købes i Studenterboghandelen .

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
(a) Godkendelse af laboratorieresultater, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser; laboratorieøvelserne vægtes med 1 ECTS ud af kursets 5 ECTS (01000112).
(b) 4 timers skriftlig eksamen med alle hjælpemidler, undtagen enhver form for kommunikation med andre personer. Eksamensbesvarelsen skal afleveres fuldstændigt i elektroniske form, uploaded til en nærmere angiven adresse. Karakter efter 7-trins skala, ekstern censur (01000102).

Reeksamen efter 4. kvartal.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatorisk laboratorieøvelser (12 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2012 til 31. august 2013.