Hold | Type | Dag | Tidsrum | Lokale | Uger | Kommentar |
---|---|---|---|---|---|---|
Fælles | I | Mandag | 08-10 | U14 | 06-10 | |
S1 | TL | Mandag | 10-17 | 10-12 | ||
S1 | TL | Torsdag | 10-17 | 10-11 | ||
S2 | TL | Tirsdag | 10-17 | 10-12 | ||
S2 | TL | Fredag | 10-17 | 10-11 | ||
S3 | TL | Onsdag | 10-17 | 10-12 | ||
S3 | TL | Lørdag | 10-17 | 10-11 |
LØ (1 uge, mandag-fredag, kl. 9.00-16.00) afholdes efter aftale med de studerende i starten af semesteret . Laboratorieøvelserne afholdes i 3-mandshold (9 stud. Pr. uge). Der er tre hold (3x9 studerende,27 deltagere i alt), hvert hold har en hel uge i lab.
Indgangskrav:
Ingen
Faglige forudsætninger:
Enten semesterkurserne BM111, BM112 og BM 113 eller kvartalskurserne BMB503 og BMB506 skal være bestået.
Kursusintroduktion
At introducere de studerende til teorien bag og den praktiske anvendelse af en række moderne proteinkemiske metoder inden for bioteknologien med særlig henblik på proteinstrukturanalyse
Kompetencer
Basalt kendskab til: Oprensning af peptider ved reversed phase HPLC; Edman degradation; Amino syre analyse; SDS gel elektroforese; Peptide mass fingerprinting; Massespektrometrisk analyse af proteiner og peptider; Ms/ms sekventering af peptider.
Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:
• Beskrive den primære struktur af et protein samt forklare hvordan man klassisk analyserer primær strukturen
• Beskrive principperne i separation af polypeptider vha. HPLC
• Beskrive principperne i gel elektroforese
• Beskrive principperne i aminosyreanalyse, Edman degradation samt massespektrometri af polypeptider, kunne behandle data herfra samt integrere disse til løsning af protein primær struktur
• Beskrive principperne i massespektrometrisk proteinidentifikation samt kunne analysere data herfra
• Beskrive principperne i massespektrometrisk sekventering af peptider samt kunne analysere ms/ms data
• At kunne evaluere de i kurset anvendte teknikker i analysen af protein strukturer.
• At kunne benytte de i kurset anvendte programmer
Emneoversigt
Øvelseskurset omfatter omvendt fase højtryksvæske-kromatografi, massespektrometri, aminosyreanalyse, proteinsekventering, enzymspaltning og derivatisering af proteiner og peptider
Litteratur