BMB524: RIBOREGULATION I BAKTERIER- Struktur og Funktion af Regulatoriske RNA molekyler (10 ECTS)

STADS: 01008901

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: valentin@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Samlæses med BMB807

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Det forventes at kurserne i Fundamental Molekylær Biologi (BMB504), Fundamental Mikrobiologi (BMB507) og Biomedicinsk Mikrobiologi (BMB510) er bestået. Det anbefales, at man har fuldt kurserne i Bioinformatik 1 (BMB511) og Avanceret Molekylær Biologi (BMB508).

Kursusintroduktion
1) At give den studerende en ”up to date” forståelse af genregulation samt kendskab til et nyt ”hot” forskningsfelt, som har klargjort, at alle typer af organismer indeholder et meget stort antal regulatoriske RNA molekyler, som er af afgørende betydning for deres biologi.
2) At give den studerende kendskab til moderne teknikker / metoder som anvendes i studier af genomer og genregulation.

Kompetencer
De studerende vil opnå et fundamentalt kendskab til RNA molekylers biologi og herigennem:
• opnå et detaljeret kendskab til cellulære processer som styres af ikke-kodende
RNA molekyler.
• gøre rede for de grundliggende mekanismer på molekylært plan.
• gøre rede for og beskrive mikroorganismers respons til det ydre miljø.
• gøre rede for ligheder og forskelle i pro- og eukaryot RNA kontrol.
• opnå praktisk kendskab til molekylærbiologiske metoder til analyse af regulatoriske RNAer
og post-transkriptiptionel kontrol af genekspression.
• få kompetencer i tolkning og diskussion af artikler fra videnskabelige tidsskrifter.

Forventet læringsudbytte


Emneoversigt

• ”non-coding” RNA, en ny og ekspanderende klasse af cellulære regulatorer: Historisk resumé, udbredelse og betydning.
• Identifikation af ncRNA: Den klassiske og den moderne fase i ”jagten” på små ncRNAer
• Funktionel klassificering af ncRNA molekyler:
  I) Regulator af protein aktivitet.
  II) Regulator af translation og/eller stabilitet af mRNAer
• Molekylære mekanismer for regulatoriske RNA’er i bakterier
  Opdagelse og betydning af et konserveret RNA bindende protein:
  Hfq, et bakterielt Sm-protein som formidler RNA-RNA interaktion
• Struktur og funktion af Sm lignende proteiner
• Fysiologisk betydning af regulatoriske RNAer i bakterier:
  Regulator af sukkermetabolisme
  Regulator af jern-metabolisme
  Regulator af bakteriel adaptation: stress inducerede nc-RNAer
  Regulator af alternative sigma-faktorer: E og S paradigmerne
  Modulering af den bakterielle overflade
  Regulering af virulens
  
  • Strategier til klarlægning af nc-RNA funktion:
  Genearrays, proteomics og computer baserede søgninger.
  
  • Medicinsk og bioteknologisk anvendelse af antisense RNA-kontrol.
  
  • Status og uløste problemer omkring antisense RNA regulation.

Litteratur

• Noter: : Riboregulation I bakterier (BMB524), .
• Øvelsesvejledning I BMB524, : .

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:

1. Laboratorieøvelserne bedømmes samlet med bestået/ikke bestået ved underviser. Aktiv deltagelse er en forudsætning for at bestå kurset.(01008912)
2. Kurset afsluttes med en mundtlig eksamen med karakter efter 7-trinsskalaen og ekstern censur. 10 ECTS. (01008902)

Reeksamen i samme termin eller umiddelbart derefter

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger, antal timer 20. Eksaminatorietimer/opgaveregning, antal timer 5. Laboratorieøvelser, antal timer 70. Forelæsninger vil inkludere artikelgennemgang og eksaminatorier vil inkludere opgaveregning og gennemgang af projektarbejde (5 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk, hvis der deltager internationale studerende, ellers undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Dette er den nyeste version af en kursusbeskrivelse, som trådte i kraft den 1. sep 2013.