BMB530: Grundlæggende biokemi (5 ECTS)

STADS: 01012801

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: frankk@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
brewer@memphys.sdu.dk
lfo@bmb.sdu.dk
adelinar@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Indgangskrav:
Ingen.

Faglige forudsætninger:
Studerende, der følger kurset, forventes at:

• Have kendskab til biologi, kemi og databehandling
• Kunne anvende Word og Excel
• Kunne forberede eksperimentelle øvelser efter anvisning i protokol

Formål
Kurset har til formål at sætte den studerende i stand til at forstå enzymers basale katalytiske egenskaber  og virkemåde, membraners opbygning og funktion samt et basalt kendskab til eukaryote cellers biokemi på molekylært niveau. De studerende indføres i den grundlæggende teori om enzymer og membraner, samt de metoder, der anvendes i arbejdet med disse. Endvidere gennemgås udvalgte biokemiske processer i dyre- og planteceller med fokus på metabolske omsætningsveje i pattedyrceller og deres regulering.        

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurset FF503 og giver et fagligt grundlag for at tilegne sig viden om cellers biokemi i forhold til fagområder indenfor farmakologi, kemi og biologi.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på:

• at anvende metoder inden for enzymkinetik og biokemi i teori og praktisk
• vidensdannelse og eksperimentelle metoder inden for det farmaceutiske/biologiske område og tilstødende fagområder
• selvstændigt at anvende en række laboratorieteknikker indenfor det biokemiske fagområde

Målbeskrivelse
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:

• anvende metoder inden for enzymkinetik og kemisk kinetik til teoretisk og praktisk bestemmelse af karakteristiske konstanter, som f.eks. enzymers KM og turnover number
• forklare, hvorledes enzymers aktiviteter reguleres, herunder allosteri
• forklare biologiske membraners opbygning, samt hvorledes stoffer transporteres igennem disse
• identificere biologiske membraners kemiske bestanddele
• beskrive nogle reaktionsmekanismerne for simple enzymkatalyserede reaktioner
• beskrive det termodynamiske og kinetiske grundlag for metabolismen samt forklare den frie energi og ligevægtskonstantens betydning for koblede reaktioner i metabolismen og ATP´s universelle rolle heri
• beskrive transport af glukose i blodet og hvorledes den cellulære optagelse finder sted
• beskrive metabolitter, enzymer og coenzymer fra glykolysen, glukoneogenesen, citronsyrecyklus, glyoxylatcyklus og principperne for regulering og integrering af reaktionsvejene
• beskrive fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanisme i planter
• beskrive reaktionsvejen og den overordnede regulering for metabolitter, enzymer og coenzymer i pentose fosfat cyklus

Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:

• Kemisk kinetik  og termodynamik
• Simpel Michaelis-Menten kinetik
• Kooperativitet og allosteri
• Regulering af enzymaktivitet
• Eksempler på enzymreaktionsmekanismer
• Biologiske membraners bestanddele
• Lipidstrukturer i vandig opløsning
• Modeller af biologiske membraner
• Diffusion af stoffer gennem membraner
• Aktiv og passiv membrantransport
• Ionkanaler
• Metabolisme: basale begreber og principper
• Glykolyse og gluconeogenese
• TCA
• Oxidativ fosforylering
• Glykogen metabolisme
• Fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanismer
• Eksperimentelle teknikker i biokemi

De studerende vil få lejlighed til at undersøge simple biokemiske problemstillinger gennem 2 laboratorieøvelser á 4 timer hver:

• 1. øvelse: enzymkinetik
• 2. øvelse: stoftskifte i gærceller

Litteratur

• Laurence A. Moran (Author), Robert A Horton (Author), Gray Scrimgeour (Author), Marc Perry (Author): Principles of Biochemistry , 5th Edition.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver

1. Deltagelse i laboratorieøvelser er en forudsætning for eksamensaktivitet a). Bestået/ikke-bestået, intern bedømmelse ved underviser. (01012822).

Eksamen- og censurform:

1. Rapporter over laboratorieøvelser. Bestået/ikke-bestået, intern bedømmelse ved underviser. Hjælpemidler tilladt. (1 ECTS). (01012812).
2. Skriftlig eksamen. Ingen trykte eller digitale hjælpemidler, kun egne håndskrevne noter må medbringes. Bedømmes ved 7-trinsskalaen ved ekstern censur. (4 ECTS).(01012802).

Den skriftlige eksamen afholdes som en digital eksamen på e-learn. Nærmere beskrivelse af eksamensreglerne vil blive offentliggjort under 'Course Information' på kursets side i Blackboard.

Reeksamen i samme eksamenstermin eller i umiddelbar forlængelse heraf. Reeksamen i del a) vil være en mundtlig eksamen (bestået/ikke-bestået med intern censur). Reeksamen i del b) kan have en anden form end den ordinære eksamen.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 22 timer
Træningsfase: 28 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 20 timer
 - Laboratorieøvelser: 6 timer

Aktiviteter i studiefasen

Undervisningsform
Aktiviteter i studiefasen:

• Gruppearbejde og rapportskrivning
• Studiegrupper omhandlende eksaminatorieøvelser (valgfrit)
• Eksamensforberedelse ved fordybelse i målbeskrivelse
• Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser

Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2016 til 31. august 2018.