BMB532: Fundamental Biokemi (10 ECTS)
STADS: 01008201
Niveau
Bachelorkursus
Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
Ansvarlige undervisere
Email: bagatolli@bmb.sdu.dk
Yderligere undervisere
lfo@bmb.sdu.dk
b.vester@bmb.sdu.dk
cse@bmb.sdu.dk
Skemaoplysninger
Hold |
Type |
Dag |
Tidsrum |
Lokale |
Uger |
Kommentar |
Fælles |
I |
Mandag |
12-14 |
U140 |
36 |
|
Fælles |
I |
Mandag |
10-12 |
U55 |
49 |
|
Fælles |
I |
Tirsdag |
12-14 |
U43 |
37,39 |
|
Fælles |
I |
Tirsdag |
12-14 |
U1 |
38 |
|
Fælles |
I |
Tirsdag |
12-14 |
U48a |
47 |
|
Fælles |
I |
Onsdag |
08-10 |
U140 |
44 |
|
Fælles |
I |
Torsdag |
10-12 |
U55 |
36-40,45-46 |
|
Fælles |
I |
Torsdag |
12-14 |
U48a |
44 |
|
Fælles |
I |
Fredag |
08-10 |
U140 |
36-40,44-48 |
|
Fælles |
I |
Fredag |
10-12 |
U140 |
49 |
|
S1 |
TL |
Mandag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
47-48 |
|
S1 |
TE |
Tirsdag |
10-12 |
U142 |
37-39 |
|
S1 |
TE |
Tirsdag |
10-12 |
U91 |
40-41,45-48 |
|
S1 |
TE |
Onsdag |
12-14 |
U142 |
49-50 |
|
S1 |
TE |
Onsdag |
10-12 |
U145 |
51 |
|
S1 |
TL |
Torsdag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
39-40 |
|
S1 |
TE |
Fredag |
08-10 |
U49d |
41 |
|
S2 |
TE |
Mandag |
12-14 |
U69a |
37-38 |
|
S2 |
TE |
Mandag |
12-14 |
U68 |
39 |
|
S2 |
TE |
Mandag |
12-14 |
U68 |
40 |
|
S2 |
TE |
Mandag |
12-14 |
U68 |
41,45-50 |
|
S2 |
TL |
Tirsdag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
39-40,47-48 |
|
S2 |
TE |
Torsdag |
12-14 |
U147 |
51 |
|
S2 |
TE |
Fredag |
14-16 |
U49d |
41 |
|
S3 |
TL |
Tirsdag |
10-14 |
BMBs øvelseslab |
40 |
|
S3 |
TE |
Tirsdag |
14-16 |
U69a |
50 |
|
S3 |
TE |
Onsdag |
16-18 |
U145 |
51 |
|
S3 |
TE |
Torsdag |
08-10 |
U146 |
40 |
|
S3 |
TE |
Torsdag |
16-18 |
U146 |
41 |
|
S3 |
TE |
Fredag |
12-14 |
U49d |
37-39,41,44-48 |
|
S3 |
TL |
Fredag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
39,47-48 |
|
S4 |
TE |
Tirsdag |
14-16 |
U142 |
37-41,46-49 |
|
S4 |
TE |
Tirsdag |
12-14 |
U142 |
50 |
|
S4 |
TL |
Onsdag |
08-12 |
BMBs øvelseslab |
39-40,47 |
|
S4 |
TE |
Onsdag |
08-10 |
U145 |
51 |
|
S4 |
TE |
Torsdag |
08-10 |
U146 |
41 |
|
S4 |
TL |
Torsdag |
08-12 |
BMBs øvelseslab |
48 |
|
S4 |
TE |
Fredag |
16-18 |
U10 |
44 |
|
S5 |
TL |
Mandag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
39-40 |
|
S5 |
TL |
Tirsdag |
08-12 |
BMBs øvelseslab |
47-48 |
|
S5 |
TE |
Onsdag |
08-10 |
U146 |
41 |
|
S5 |
TE |
Torsdag |
14-16 |
U147 |
40 |
|
S5 |
TE |
Torsdag |
14-16 |
U147 |
51 |
|
S5 |
TE |
Fredag |
10-12 |
U49d |
37-39,41,44-48 |
|
S5 |
TE |
Fredag |
14-16 |
U49d |
49 |
|
S6 |
TE |
Mandag |
08-10 |
U49d |
37-41,45-50 |
|
S6 |
TL |
Onsdag |
14-18 |
BMBs øvelseslab |
39-40,47-48 |
|
S6 |
TE |
Onsdag |
12-14 |
U146 |
41 |
|
S6 |
TE |
Onsdag |
14-16 |
U145 |
51 |
|
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.
Indgangskrav:
Ingen
Faglige forudsætninger:
FF502: Fysik og matematik: Den matematiske modellerede videnskab. FF503: Kemi, Biologi og Molekylær Biologi - Den empiriske eksperimentielle videnskab. Alternativt: BB501, Biologi – fra molekyle til økosystem eller BB508 Dyre- og plantebiologi og MM502-Calculus II eller MM504-BioMat II skal være bestået. Endvidere forudsættes BMB 501 Biomolekylær kemi kendt.
KursusintroduktionFormålet med kurset er at give de studerende en grundig indføring i enzymers katalytiske egenskaber og virkemåde, i membraners opbygning og funktion samt et basalt kendskab til eukaryote cellers biokemi på molekylært niveau. De studerende indføres i den basale teori om enzymer og membraner, samt de metoder, der anvendes i arbejdet med disse. Endvidere gennemgås de biokemiske processer i dyre- og planteceller med fokus på de metaboliske omsætningsveje i pattedyrceller og deres regulering.
Forventet læringsudbytteNår kurset er færdigt, forventes den studerende at kunne:
- anvende metoder inden for enzymkinetik og kemisk kinetik til teoretisk og praktisk bestemmelse af karakteristiske konstanter, som f.eks. enzymers KM og turnover number
- anvende teorien om kemisk kinetik og enzymkinetik til at opskrive hastighedsudtryk for ukatalyserede og enzymkatalyserede reaktioner
- anvende klassisk termodynamik på biologiske problemstillinger
- forklare, hvorledes enzymers aktiviteter reguleres, herunder allosteri og effekten af protoner
- forklare biologiske membraners opbygning, samt hvorledes stoffer transporteres igennem disse
- identificere biologiske membraners kemiske bestanddele, og beskrive strukturerne af membranlipider i vandig opløsning
- beskrive eksperimentelle teknikker til undersøgelse af enzymer og membraner, herunder spektrofotometri og fluorescensspektroskopi
- beskrive reaktionsmekanismerne for simple enzymkatalyserede reaktioner
- beskrive bindingen af ligander til membranreceptorer
- beskrive det termodynamiske og kinetiske grundlag for metabolismen samt forklare den frie energi og ligevægtskonstantens betydning for koblede reaktioner i metabolismen og ATP´s universelle rolle heri
- beskrive transport af glukose og lipider i blodet og hvorledes den cellulære optagelse finder sted
- beskrive metabolitter, enzymer og coenzymer fra glycolysen, gluconeogenesen, citronsyrecyklus, glyoxylatcyklus og principperne for regulering og integrering af reaktionsvejene
- beskrive fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanisme i planter
- beskrive reaktionsvejen og den overordnede regulering for metabolitter, enzymer og coenzymer i pentose fosfat cyclus
- beskrive metabolitter, enzymer, coenzymer i glykogen- og og den centrale fedtsyremetabolisme samt reguleringen heraf
- beskrive virkningen af hormonerne insulin, glukagonog adrenalin på de metaboliske omsætningsveje i hjerne, muskler, lever og fedtvæv
- beskrive de mekanismer der ligger til grund for den hormonelle påvirkning af blodets indhold af glukose og fedtsyrer
EmneoversigtFølgende emner vil blive behandlet:
- Termodynamik, herunder termodynamikkens 1. og 2. hovedsætning med hovedvægt på begrebet entropi
- Eksperimentelle teknikker til undersøgelse af enzymer og membraner, især spektrofotometri og fluorescens spektroskopi
- Kemisk kinetik – herunder første og anden ordens reaktioner
- Simpel Michaelis-Menten kinetik
- Bisubstratreaktioner
- Kooperativitet og allosteri
- Regulering af enzymaktivitet
- Eksempler på enzymreaktionsmekanismer
- Biologiske membraners bestanddele
- Lipidstrukturer i vandig opløsning
- Singer-Nicholson modellen af biologiske membraner
- Lokale lipid strukturer
- Diffusion af stoffer gennem membraner
- Aktiv og passiv membrantransport
- Ionkanaler
- Membranreceptorer
- Metabolisme: basale begreber og principper
- Glykolyse og gluconeogenese
- TCA
- Oxidativ phosphorylation
- Glycogen metabolisme
- Lipidmetabolisme, herunder fedtsyre syntese og nedbrydning
- Fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanismer
- Integration af metabolismen
De studerende vil få lejlighed til at undersøge simple biokemiske problemstillinger gennem 4 laboratorieøvelser a 4 timer.
- øvelse: enzymøvelse svarende til øvelsen på bmb502
- øvelse: membranøvelse svarende til øvelsen på bmb502
- øvelse: undersøgelse af alkalisk fosfatase aktivitet
- øvelse: øvelse om oxidativ fosforylering
Litteratur
Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter
e-learn (blackboard).
Forudsætningsprøver
Ingen
Eksamen- og censurform:
- Beståede laboratorieøvelser. Bestået/ikke-bestået, intern censur. Bestået øvelseskursus (rapporter) en forudsætning for at indstille sig til eksamen, (01008212)
- Skriftlig eksamen. Ekstern censur. Karakter efter 7-trinsskalaen, 10 ECTS (01008202)
Reeksamen i samme eksamenstermin eller i umiddelbar forlængelse heraf.
Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 54 timer
Træningsfase: 40 timer, heraf:
- Eksaminatorie: 24 timer
- Laboratorieøvelser: 16 timer
Aktiviteter i studiefasen
Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren.
Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.
Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.
Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2013 til 31. august 2014.