BMB534: Experimentel Proteinkemi (5 ECTS)
STADS: 01011401Niveau
Bachelorkursus
Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
4. kvartal. Kurset afvikles i august måned.
Ansvarlige undervisere
Email: php@bmb.sdu.dkSkemaoplysninger
| Hold | Type | Dag | Tidsrum | Lokale | Uger | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Fælles | I | Mandag | 09-16 | Blue lab og Green Room | 33 | |
| Fælles | I | Tirsdag | 09-16 | Blue lab og Green Room | 33 | |
| Fælles | I | Onsdag | 09-16 | Blue lab og Green Room | 32-33 | |
| Fælles | I | Torsdag | 09-16 | Blue lab og Green Room | 32-33 | |
| Fælles | I | Fredag | 09-16 | Blue lab og Green Room | 32 |
Vis personligt skema for dette kursus.
Indgangskrav:
Ingen
Faglige forudsætninger:
BMB506 Proteinkemi - Bestået
Kursusintroduktion
Formålet med kurset er at give de studerende en indføring i basale proteinkemiske teknikker som benyttes til karakterisering afproteiners primære struktur samt identifikation af proteiner.
Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
• Beskrive den primære struktur af et protein samt forklare principperne i de vigtigse metoder til primær analyse af proteinstruktur
• Forklare principperne i separation af polypeptider vha. HPLC
• Beskrive principperne i gel elektroforese
• Forklare principperne i aminosyreanalyse, Edman degradation samt massespektrometri af polypeptider, kunne behandle data herfra samt integrere disse til løsning af protein primær struktur
• Forklare princippet i et MALDI massespektrometer
• Forklare principperne i massespektrometrisk proteinidentifikation samt kunne analysere data herfra
• Forklare principperne i massespektrometrisk sekventering af peptider samt kunne analysere ms/ms data
• At kunne evaluere de i kurset anvendte teknikker til analyse af protein strukturer.
• At kunne benytte de i kurset anvendte programmer
Emneoversigt
Følgende emner vil blive behandlet:
1. Proteiners primære struktur
2. Aminosyrernes kemiske egenskaber
3. Principperne i aminosyreanalyse samt anvendelse til
a) Protein/peptid karakterisering
b) Kvantitering
4. Protein sekventering i form af
a) Edman degradation
b) Massespektrometrisk sekventering
5. SDS gelelektroforese af proteiner
6. Væskekromatografi
a) Reverse phase til peptidseparation
b) Ionbytning
c) Solid phase extraction
7. Basal massespektrometri (MALDI)
a) Intakt masse analyse
b) Peptide mass fingerprinting
c) MS/MS til identifikation
8. Bioinformatisk proteinanalyse
Litteratur
- Oplyses senere
Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).
Forudsætningsprøver
Ingen
Eksamen- og censurform:
Projektopgave. Bestået/ikke bestået, intern censur. Øvelsesrapport afleveres 3 uger efter kursets afslutning. (01011402)
Øvelsesrapport kan genafleveres inden for to uger efter rettelse
Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Forelæsning, 8 timer
Eksaminatorier, 4 timer
Laboratorieøvelser, 35 timer
Det præcise forhold mellem undervisningsformer kan variere
Aktiviteter i studiefasen
Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.
Bemærkninger
Øvelsesrapport kan genafleveres inden for to uger efter rettelse.
Dette øvelseskursus udføres ifølge lovmæssige sikkerhedsanvisninger, men anvender eksperimentelle protokoller og kemikalier, som er mistænkt for at være potentielt skadelige for gravide/ammende. Gravide/ammende studerende bør derfor i god tid før kursustilmelding kontakt den kursusansvarlige.
Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.
Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.
Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2015 til 31. januar 2016.
