BMB818: Ekstremofile mikrober: Mikrobiologi og bioteknologi (5 ECTS)

STADS: 01011901

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: r.p.cox@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Mandag 08-10 U142 9
Fælles I Mandag 12-14 U10 11,13
Fælles I Tirsdag 08-10 U66 6
Fælles I Onsdag 08-10 U142 7
Fælles I Onsdag 10-12 U10 16
H1 TE Mandag 12-14 U145 12,14
H1 TL Mandag 10-14 *Odense Lokalitet aftales 1 19-21 Laboratorier efter aftale
H1 TE Tirsdag 12-14 U145 17
H1 TE Torsdag 10-12 U143 8
H1 TE Torsdag 16-18 U145 10
H1 TE Fredag 10-12 U145 8
H1 TE Fredag 16-18 U145 10
H1 TE Fredag 12-14 U145 12,14
H1 TE Fredag 12-14 U142 17
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Max 16 studerende

Indgangskrav:
Ingen formelle kav

Faglige forudsætninger:
Faglige forudsætninger. Studerende, der følger kurset, forventes at:
  • Have kendskab til basale mikrobiologi, biokemi og molekylær biologi svarende til en bachelorgrad i biovidenskab
  • Kunne anvende Powerpoint eller lignende
  • Beherske engelsk på et niveau således at de kan afholde mundtlige præsentationer og skrive rapporter.
 


Formål
Kurset har til formål at den studerende opnår en bredere kendskab til og forståelse af livets diversitet gennem en diskussion af mikrober som  er tilpasset ekstreme miljøer. Gennem kurset får de studerende erfaring i at læse og forstå nyere faglitteratur samt fremlægge aktuelle resultater og problemstillinger. De studerende vil også få erfaring med laboratorieundersøgelser af ekstremofile mikrober.

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i grundliggende kurser i biokemi, molekylær biologi og mikrobiologi (BMB507, BB509  eller lignende), og bidrager til det fagligt grundlag for et mikrobiologisk speciale samt ansættelse i den bioteknologiske industri.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give kompetence til selvstændigt og på højeste faglige niveau tilegne sig ny viden på en effektiv og selvstændig måde og anvende denne viden refleksivt.
  • Give færdigheder i at forholde sig kritisk til forskningsresultater, samt give færdigheder i mundtlig og skriftlig  formidling af forskningsbaseret viden
  • Give viden om teorier og eksperimentelle metoder baseret på moderne forskning inden for mikrobiologi, og viden om mikrobiologiens berøringsflade mod moderne bioteknologi og miljøteknologi 

 



Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
  • foretage en kritisk vurdering af originale forskningslitteratur om ekstremofile mikrober og præsentere resultater på engelsk
  • beskrive forskellige typer of ekstreme miljøer og deres mikrobiota og forklar hvordan Bacteria og Archaea kan overleve og vokse i disse miljøer
  • give eksempler af bioteknologiske anvendelse af ekstremofile mikrober
  • arbejde med ekstremofile mikrober i laboratoriet, herunder isolering af renkulturer samt identificering med anvendelse af ribosomale RNA gensekvense
 


Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Ekstreme miljøer og ekstremofile mikrober 
  • Biologi af Archaea 
  • Høje temperaturer - termofiler 
  • Lave temperaturer – psychrofiler 
  • Ekstreme pH værdier – acidofiler og alkalifiler 
  • Ekstreme saltkoncentrationer  – halofiler 
  • Miljøer med lavt næringsindhold – oligotrofer 
  • Ekstremt langsom vækst og langtidsoverlevelse
  • Ekstremofile fototrofer 
 


Litteratur
Der er i øjeblikket ikke angivet nogle materialer for kurset.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
  1. Tilfredstillende præsentation af 2 forskningsartikler samt godkendelse af rapport over laboratorieactiviter. Bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser. (01011912).


Eksamen- og censurform:
  1. Rapport. Intern censur med karakter efter 7-trins skalaen (5 ECTS). (01011902).


Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 12 timer
Træningsfase: 32 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 20 timer
 - Laboratorieøvelser: 12 timer

Aktiviteter i studiefasen
  • Læsning af forskingsartikler og forberedelse af præsentationer i Powerpoint eller lignende
  • Læsning af artikler som præsenteres af andre studerende som forberedelse til aktiv deltagelse i diskussion
  • Udarbejdelse af en individuel rapport over laboratoriearbejdet
  • Udarbejdelse af den endelig rapport
Undervisningsform
Kursets introfase består af 12 timers forelæsninger hvor kursets hovedemner introduceres.
Træningsfasen indeholder 20 skemalagte timer hvor de studerende afholder præsentationer i Powerpoint eller lignende med efterfølgende diskussion, samt 12 timers laboratoriearbejde hvor studerende arbejder individuelt på en mindre projekt hvor en renkultur af en ekstremofil mikrobe isoleres og identificeres gennem gensekventering.

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Bemærkninger
Kurset kan følges af bachelorstuderende med forudsætninger i mikrobiologi (BMB507 eller BB509)

Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:
  1. Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen har første prioritet
  2. Studerende, der er optaget betinget på kandidatuddannelsen har hernæst prioritet
  3. Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
  4. Bachelorstuderende
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 4, trækkes der lod.
 
De faglige miljøer på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.

Forudsætningen for at beholde pladsen på kurset er personligt fremmøde første kursusdag eller på anden måde underretning til underviseren. Ved manglende fremmøde eller underretning i øvrigt optages kursuspladsen af studerende fra ventelisten, i den rækkefølge ventelisten angiver. 
 


Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2017 til 31. januar 2019.