KE803: Molecular modelling (5 ECTS)

STADS: 10002701

Niveau
Kandidatkursus forhåndsgodkendt som PhD-kursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: kongsted@sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Samlæses med KE534

Indgangskrav:
Bachelorgrad i Kemi, Nanobioscience, Farmaceutisk kemi, Lægemiddelvidenskab, Farmaci eller ingeniørvidenskab med kemi, eller bachelorsidefag i kemi.

Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået KE534.

Faglige forudsætninger:
Studerende, der følger kurset, forventes at være bekendte med indledende kvantekemi, grundlæggende matematisk analyse og lineær algebra samt indledende organisk kemi.

Formål
Formålet med kurset er at er at give de studerende en oversigt over moderne metoder inden for beregningskemien. Der fokuseres specielt på anvendelser inden for den organiske kemi.

Kurset bygger delvist oven på den viden der er erhvervet i KE522 (kvantekemi og teoretisk spektroskopi) eller KE818 og KE529 (matematiske metoder for kemi) eller tilsvarende, og giver et fagligt grundlag for at forstå moderne modelleringsmetoder med bred anvendelse i kemiuddannelsen.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at gøre den studerende i stand til at kunne analysere og arbejde med problemstillinger indenfor kemi med udgangspunkt i moderne modellering samt at udføre beregninger på typiske kemiske problemstillinger.

Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

• identificere og beskrive de moderne beregningskemiske metoder nævnt i emneoversigten;
• vurdere disse beregningskemiske metoders styrker og svagheder i forhold til løsning af problemer inden for organisk kemi;
• udvælge relevante beregningskemiske metoder til at studere et givet problem;
• udføre computerberegninger med de valgte beregningskemiske metoder til løsning af et givet problem og fortolke resultatet af beregningerne.

Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder: Force field-metoder, elektronstrukturmetoder, herunder ab-initio, og DFT, molekyldynamik og docking. Kurset vil fortrinsvis lægge vægt på anvendelse af ovennævnte metoder til løsning af praktiske problemer. Ved øvelserne vil metoderne blive illustreret ved brug af beregningsprogrammet Schrödinger.

Litteratur

• Frank Jensen: Introduction to Computational Chemistry, 3nd ed., Wiley.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:

1. Kurset evalueres med en projektopgave, der bedømmes med bestået/ikke-bestået og intern censur. Projektopgaven kan udføres i grupper af max. to deltagere. Individuel bedømmelse. (5 ECTS). (10002702).

Reeksamen i samme eksamenstermin eller i umiddelbar forlængelse heraf.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 20 timer
Træningsfase: 30 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 30 timer

Aktiviteter i studiefasen
Aktiviteter i studiefasen:

• Læsning af lærerbogens materiale
• Opgaveløsning
• Udarbejdelse af afsluttende projekt

Undervisningsform

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk, hvis der deltager internationale studerende, ellers undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2016 til 31. august 2018.