BMB202: Proteinoprensning (10 ECTS)

STADS: 01003901

Niveau
PhD-kursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
1. og 2. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: nils.f@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
jkk@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Max 12 på hvert hold i lab. pr. uge. Labøvelserne ligger i uge 42 og 44. De studerende placeres på hold i enten uge 42 eller 44. (Lokale: Den sorte firkant) Holdinddeling til laboratorieøvelserne finder sted ved forelæsningerne.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Bestået bachelorgrad. Kurset kan tages af kandidatstuderende, men vær opmærksom på, at dette er et ph.d.-kursus, og at niveauet derfor er meget højt.

Kursusintroduktion
Kursets formål er at introducere deltagerne i teorien bag og anvendelsen af de mest almindelige proteinoprensningsmetoder.

Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

- diskutere og analysere hvordan fedtsyresyntesen forløber i bakterier, simple eukaryote celler som gærceller samt pattedyrceller herunder de forskellige fedtsyresyntese-enzymsystemer i hhv. cytosolen og i mitochondrier.
- diskutere virkningsmekanismen bag fedtsyresyntese, elongering og terminering
- udvælge præcise metoder til homogenisering af specifikke væv og celler
- evaluere fordele og ulemper ved ionbytnings-, gelfiltrerings- og affinitetskromatografi
- diskutere og analysere teorien bag søjlekromatografi og de faktorer der påvirker oprensningen og adskillelsen af proteiner.
- diskutere teorien bag proteiners opløselighed og hvorledes denne kan påvirkes af salt, organiske opløsningsmidler, temperatur, og pH.
- diskutere og analysere principperne bag elektroforetisk adskillelse af molekyler, herunder proteiner.
- diskutere og perspektivere anvendelsen af elektroforese i forståelsen af proteiners egenskaber og struktur.
- diskutere og vurdere typiske teknikker som anvendes til koncentrationsbestemmelse af proteiner.

Emneoversigt
Kurset består af en teoretisk del, hvor teorien bag de anvendte metoder gennemgås, og en praktisk del, hvor et bestemt protein oprenses ved hjælp af de gennemgåede metoder. De anvendte metoder omfatter fraktionering af cellebestanddele ved centrifugering og proteinfraktionering ved hjælp af fældning, ionbytningskromatografi og gelfiltreringskromatografi. Endvidere vil deltagerne komme til at udføre fotometriske bestemmelser af proteinindhold og enzymaktiviteter. Renheden af det oprensede protein og dets molvægt bestemmes ved hjælp af gelelektroforese.

Litteratur

• Robert K, Scopes: Protein Purification - Principles and Practice, Springer Verlag, 3. udgave.

Pensum
Se pensumbeskrivelse.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Godkendelse af rapport, som danner grundlag for mundtlig eksamen. Ekstern censur. Karakter efter 7-trinsskalaen.
Rapporten kan afleveres i grupper af to studerende. Der afholdes gruppeeksamen med individuel vurdering.

Reeksamen efter 4. kvartal.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger og laboratorieøvelser.
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk, hvis der deltager internationale studerende, ellers undervises på dansk.

Bemærkninger
Kurset erstatter BK/BKP24 Proteinoprensning.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2008 til 31. august 2010.