2012 Forår 2011 Forår 2010 Forår 2009 Forår 2008 Forår 2007 Forår 2006 Forår
Se studieforløb hvor kurset indgår Se overgangsordninger
Dansk English

BMB501: Biomolekylær Kemi (5 ECTS)

STADS: 01000101

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: f.kir@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
ebp@ifk.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Mandag 10-12 U55 05-10
Fælles I Fredag 12-14 U55 05-10
S1 TL Tirsdag 14-18 IFK lab 5 og 6 9
S1 TL Tirsdag 12-16 BMB 10-11
S1 TE Onsdag 14-16 U17 06-11
S2 TL Mandag 08-12 BMB 11
S2 TL Torsdag 13-17 IFK lab 5 og 6 9
S2 TL Torsdag 13-17 BMB 10
S2 TE Fredag 10-12 U17 06-11
S3 TE Tirsdag 14-16 U17 06-11
S3 TL Onsdag 14-18 IFK lab 5 og 6 9
S3 TL Onsdag 12-16 BMB 10-11
S4 TE Torsdag 08-10 U17 05-09, 11
S4 TL Fredag 08-12 IFK lab 5 og 6 9
S4 TL Fredag 08-12 BMB 10-11
S5 TE Mandag 08-10 U17 06-11
S5 TL Torsdag 08-12 IFK lab 5 og 6 9
S5 TL Torsdag 08-12 BMB 11
S5 TL Lørdag 08-12 BMB 10
S6 TE Onsdag 12-14 U17 06-11
S6 TL Onsdag 08-12 IFK lab 5 og 6 9
S6 TL Onsdag 08-12 BMB 10-11
S8 TL Tirsdag 08-12 IFK lab 5 og 6 9
S8 TL Tirsdag 08-12 BMB 10-11
S8 TE Torsdag 14-16 U69 06-11
S9 TE Tirsdag 08-10 U17 06-11
S9 TL Onsdag 14-18 IFK lab 5 og 6 9
S9 TL Torsdag 13-17 BMB 11
S9 TL Lørdag 12-16 BMB 10
S10 TL Mandag 14-18 IFK lab 5 og 6 9
S10 TL Mandag 14-18 BMB 10-11
S10 TE Onsdag 10-12 U17 06-11
S12 TE Tirsdag 12-14 U17 06,11
S12 TE Tirsdag 12-14 U130 07-10
S12 TL Fredag 14-18 IFK lab 5 og 6 9
S12 TL Fredag 14-18 BMB 10
S12 TL Fredag 13-17 BMB 11
Vis hele skemaet
 Vis personligt skema for dette kursus.

Skemaændringer:
: E-timer S12 lokaleændringer.
: S9 lab hold nedlagt i uge 9. De studerende skal placeres på andre hold denne uge, bla. S3.
: Lab.øvelser for hold S5 og S9 er ændret i uge 10.

Kommentar:
Øvelsesvejledningen for laboratorieøvelserne kan findes på Blackboard.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Stoffet fra KE501 Kemi 1 - Grundlæggende Kemi samt BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem eller BB508 – Dyre- og plantebiologi forudsættes kendt.
Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået BM102.

Kursusintroduktion
Målsætningen er at give den studerende en forståelse af biomolekyler i både en kemisk og en biologisk sammenhæng. Dette gøres ved

• At introducere de centrale typer af biologiske makromolekyler; proteiner, nukleinsyrer, lipider og kulhydrater.

• At give en forståelse af, at grundlæggende organisk kemi definerer disse biologiske makromolekylers struktur og dermed deres funktion.

• At illustrere, at funktionen af biologiske makromolekyler (ofte) er af grundlæggende organisk-kemisk natur.



Kompetencer
• Kunne vurdere grundlæggende kemiske egenskabers betydning for et biomolekyles struktur

• Have en fundamental forståelse af sammenhænget mellem et biomolekyles struktur og dets funktion.

• Kendskab til kemisk syntese af biomolekyler og til biomolekylers kemiske reaktioner.

• Grundlæggende færdigheder i et biokemisk laboratorium, herunder håndtering af mikroliter volumener, udførelse af laboratorieøvelser på basis af skriftlig vejledning, reproduktion af forsøgsserier.

Forventet læringsudbytte
Når kurset teoridel er bestået, forventes den studerende at kunne:

• Angive og skitsere mekanismen for de non-kovalente kræfter, der virker i biomolekyler.
• Diskutere de fire strukturniveauer i proteiner.
• Forklare hydrofobe og hydrofile egenskabers betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Forklare steriske effekters betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Skitsere og give eksempler på sammenhænget mellem biomolekylers struktur og funktion.
• Genkende de funktionelle grupper i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Genkende heterocykliske ringe.
• Opskrive de almindelige kemiske reaktioner for ovennævnte funktionelle grupper og heterocykliske ringe.
• Kende principperne i laboratoriesyntese af nukleinsyrer og peptider.
• Anvende stereokemisk nomenklatur på biomolekyler.
• Opskrive biomolekyler og heterocykliske forbindelser ved forskellige pH-værdier

Når kurset laboratoriedel er bestået, forventes den studerende at:

• Kunne håndtere en justerbar automatpipette på reproducerbar vis.
• Lave fortyndingsserier samt måle disse spektrofotometrisk.
• Kende til gelelektroforese.
• Kunne skitsere principperne i spektrofotometrisk måling, og kende til spektrofotometrets anvendelse i studiet af biokemiske reaktioner.
• Kunne udføre en enzymatisk syntese.
• Kende til måling af stoffers optiske renhed.

Emneoversigt
1. Kulhydrater:
• Monosakkarider og deres stereokemi
• Disakkarider
• Polysakkarider og deres biologisk forskelle.

2. Nukleinsyrer
• Nukleosider og heterocyklisk kemi, inkl. tautomeri
• Nukleotider
• Oligonukleotider og deres syntese
• DNA/RNA struktur

3. Peptider
• Aminosyrer og deres organiske kemi
• Peptider; deres syntese og strukturelle egenskaber
• Proteiners struktur og funktion
• Protein–nukleinsyre genkendelse

4. Lipider
• Struktur
• Hydrofobe og hydrofile egenskaber
• Lipider og proteiner i membraner

Litteratur
  • Kirpekar & Pedersen: Biomolecular chemistry, (2nd Ed., Pearson 2006). (kan købes i Studenterboghandelen).


Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
(a) Godkendelse af laboratorieresultater, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser; laboratorieøvelserne vægtes med 1 ECTS ud af kursets 5 ECTS.
(b) 3 timers skriftlig eksamen med skriftlige hjælpemidler og lommeregner, 7-skala, ekstern censur.
(c) Reeksamen efter 4. kvartal.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatorisk laboratorieøvelser (12 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2008 til 31. januar 2010.