Dansk

BMB501: Biomolekylær Kemi (5 ECTS)

STADS: 01000101

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere

Email: f.kir@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere

ebp@ifk.sdu.dk

Skemaoplysninger

Hold	Type	Dag	Tidsrum	Lokale	Uger
Fælles	I	Mandag	10-12	U55	05-10
Fælles	I	Fredag	12-14	U55	05-10
S1	TL	Tirsdag	14-18	IFK lab 5 og 6	9
S1	TL	Tirsdag	12-16	BMB	10-11
S1	TE	Onsdag	14-16	U17	06-11
S2	TL	Mandag	08-12	BMB	11
S2	TL	Torsdag	13-17	IFK lab 5 og 6	9
S2	TL	Torsdag	13-17	BMB	10
S2	TE	Fredag	10-12	U17	06-11
S3	TE	Tirsdag	14-16	U17	06-11
S3	TL	Onsdag	14-18	IFK lab 5 og 6	9
S3	TL	Onsdag	12-16	BMB	10-11
S4	TE	Torsdag	08-10	U17	05-09, 11
S4	TL	Fredag	08-12	IFK lab 5 og 6	9
S4	TL	Fredag	08-12	BMB	10-11
S5	TE	Mandag	08-10	U17	06-11
S5	TL	Torsdag	08-12	IFK lab 5 og 6	9
S5	TL	Torsdag	08-12	BMB	11
S5	TL	Lørdag	08-12	BMB	10
S6	TE	Onsdag	12-14	U17	06-11
S6	TL	Onsdag	08-12	IFK lab 5 og 6	9
S6	TL	Onsdag	08-12	BMB	10-11
S8	TL	Tirsdag	08-12	IFK lab 5 og 6	9
S8	TL	Tirsdag	08-12	BMB	10-11
S8	TE	Torsdag	14-16	U69	06-11
S9	TE	Tirsdag	08-10	U17	06-11
S9	TL	Onsdag	14-18	IFK lab 5 og 6	9
S9	TL	Torsdag	13-17	BMB	11
S9	TL	Lørdag	12-16	BMB	10
S10	TL	Mandag	14-18	IFK lab 5 og 6	9
S10	TL	Mandag	14-18	BMB	10-11
S10	TE	Onsdag	10-12	U17	06-11
S12	TE	Tirsdag	12-14	U17	06,11
S12	TE	Tirsdag	12-14	U130	07-10
S12	TL	Fredag	14-18	IFK lab 5 og 6	9
S12	TL	Fredag	14-18	BMB	10
S12	TL	Fredag	13-17	BMB	11

Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Skemaændringer:
j. F Y: E-timer S12 lokaleændringer.
j. F Y: S9 lab hold nedlagt i uge 9. De studerende skal placeres på andre hold denne uge, bla. S3.
j. F Y: Lab.øvelser for hold S5 og S9 er ændret i uge 10.

Kommentar:
Øvelsesvejledningen for laboratorieøvelserne kan findes på Blackboard.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Stoffet fra KE501 Kemi 1 - Grundlæggende Kemi samt BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem eller BB508 – Dyre- og plantebiologi forudsættes kendt.
Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået BM102.

Kursusintroduktion
Målsætningen er at give den studerende en forståelse af biomolekyler i både en kemisk og en biologisk sammenhæng. Dette gøres ved

• At introducere de centrale typer af biologiske makromolekyler; proteiner, nukleinsyrer, lipider og kulhydrater.

• At give en forståelse af, at grundlæggende organisk kemi definerer disse biologiske makromolekylers struktur og dermed deres funktion.

• At illustrere, at funktionen af biologiske makromolekyler (ofte) er af grundlæggende organisk-kemisk natur.

Kompetencer
• Kunne vurdere grundlæggende kemiske egenskabers betydning for et biomolekyles struktur

• Have en fundamental forståelse af sammenhænget mellem et biomolekyles struktur og dets funktion.

• Kendskab til kemisk syntese af biomolekyler og til biomolekylers kemiske reaktioner.

• Grundlæggende færdigheder i et biokemisk laboratorium, herunder håndtering af mikroliter volumener, udførelse af laboratorieøvelser på basis af skriftlig vejledning, reproduktion af forsøgsserier.

Forventet læringsudbytte
Når kurset teoridel er bestået, forventes den studerende at kunne:

• Angive og skitsere mekanismen for de non-kovalente kræfter, der virker i biomolekyler.
• Diskutere de fire strukturniveauer i proteiner.
• Forklare hydrofobe og hydrofile egenskabers betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Forklare steriske effekters betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Skitsere og give eksempler på sammenhænget mellem biomolekylers struktur og funktion.
• Genkende de funktionelle grupper i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Genkende heterocykliske ringe.
• Opskrive de almindelige kemiske reaktioner for ovennævnte funktionelle grupper og heterocykliske ringe.
• Kende principperne i laboratoriesyntese af nukleinsyrer og peptider.
• Anvende stereokemisk nomenklatur på biomolekyler.
• Opskrive biomolekyler og heterocykliske forbindelser ved forskellige pH-værdier

Når kurset laboratoriedel er bestået, forventes den studerende at:

• Kunne håndtere en justerbar automatpipette på reproducerbar vis.
• Lave fortyndingsserier samt måle disse spektrofotometrisk.
• Kende til gelelektroforese.
• Kunne skitsere principperne i spektrofotometrisk måling, og kende til spektrofotometrets anvendelse i studiet af biokemiske reaktioner.
• Kunne udføre en enzymatisk syntese.
• Kende til måling af stoffers optiske renhed.

Emneoversigt
1. Kulhydrater:
• Monosakkarider og deres stereokemi
• Disakkarider
• Polysakkarider og deres biologisk forskelle.

2. Nukleinsyrer
• Nukleosider og heterocyklisk kemi, inkl. tautomeri
• Nukleotider
• Oligonukleotider og deres syntese
• DNA/RNA struktur

3. Peptider
• Aminosyrer og deres organiske kemi
• Peptider; deres syntese og strukturelle egenskaber
• Proteiners struktur og funktion
• Protein–nukleinsyre genkendelse

4. Lipider
• Struktur
• Hydrofobe og hydrofile egenskaber
• Lipider og proteiner i membraner

Litteratur

Kirpekar & Pedersen: Biomolecular chemistry, (2nd Ed., Pearson 2006). (kan købes i Studenterboghandelen).

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
(a) Godkendelse af laboratorieresultater, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser; laboratorieøvelserne vægtes med 1 ECTS ud af kursets 5 ECTS.
(b) 3 timers skriftlig eksamen med skriftlige hjælpemidler og lommeregner, 7-skala, ekstern censur.
(c) Reeksamen efter 4. kvartal.

Eksamensdato
Den ordinære eksamen finder sted den 31. marts 2008 og 6. juni 2008

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatorisk laboratorieøvelser (12 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. February 2008 til 31. January 2010.