BMB501: Biomolekylær Kemi (5 ECTS)

STADS: 01000101

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: f.kir@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
ebp@ifk.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Øvelsesvejledningen for laboratorieøvelserne kan findes på Blackboard.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Stoffet fra KE501 Kemi 1 - Grundlæggende Kemi samt BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem eller BB508 – Dyre- og plantebiologi forudsættes kendt.
Kurset kan ikke følges af studerende, der har bestået BM102.

Kursusintroduktion
Målsætningen er at give den studerende en forståelse af biomolekyler i både en kemisk og en biologisk sammenhæng. Dette gøres ved

• At introducere de centrale typer af biologiske makromolekyler; proteiner, nukleinsyrer, lipider og kulhydrater.

• At give en forståelse af, at grundlæggende organisk kemi definerer disse biologiske makromolekylers struktur og dermed deres funktion.

• At illustrere, at funktionen af biologiske makromolekyler (ofte) er af grundlæggende organisk-kemisk natur.



Kompetencer
• Kunne vurdere grundlæggende kemiske egenskabers betydning for et biomolekyles struktur

• Have en fundamental forståelse af sammenhænget mellem et biomolekyles struktur og dets funktion.

• Kendskab til kemisk syntese af biomolekyler og til biomolekylers kemiske reaktioner.

• Grundlæggende færdigheder i et biokemisk laboratorium, herunder håndtering af mikroliter volumener, udførelse af laboratorieøvelser på basis af skriftlig vejledning, reproduktion af forsøgsserier.

Forventet læringsudbytte
Når kurset teoridel er bestået, forventes den studerende at kunne:

• Angive og skitsere mekanismen for de non-kovalente kræfter, der virker i biomolekyler.
• Diskutere de fire strukturniveauer i proteiner.
• Forklare hydrofobe og hydrofile egenskabers betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Forklare steriske effekters betydning for biomolekylers struktur samt give eksempler herpå.
• Skitsere og give eksempler på sammenhænget mellem biomolekylers struktur og funktion.
• Genkende de funktionelle grupper i kulhydrater, nukleinsyrer, peptider/proteiner og lipider.
• Genkende heterocykliske ringe.
• Opskrive de almindelige kemiske reaktioner for ovennævnte funktionelle grupper og heterocykliske ringe.
• Kende principperne i laboratoriesyntese af nukleinsyrer og peptider.
• Anvende stereokemisk nomenklatur på biomolekyler.
• Opskrive biomolekyler og heterocykliske forbindelser ved forskellige pH-værdier

Når kurset laboratoriedel er bestået, forventes den studerende at:

• Kunne håndtere en justerbar automatpipette på reproducerbar vis.
• Lave fortyndingsserier samt måle disse spektrofotometrisk.
• Kende til gelelektroforese.
• Kunne skitsere principperne i spektrofotometrisk måling, og kende til spektrofotometrets anvendelse i studiet af biokemiske reaktioner.
• Kunne udføre en enzymatisk syntese.
• Kende til måling af stoffers optiske renhed.

Emneoversigt
1. Kulhydrater:
• Monosakkarider og deres stereokemi
• Disakkarider
• Polysakkarider og deres biologisk forskelle.

2. Nukleinsyrer
• Nukleosider og heterocyklisk kemi, inkl. tautomeri
• Nukleotider
• Oligonukleotider og deres syntese
• DNA/RNA struktur

3. Peptider
• Aminosyrer og deres organiske kemi
• Peptider; deres syntese og strukturelle egenskaber
• Proteiners struktur og funktion
• Protein–nukleinsyre genkendelse

4. Lipider
• Struktur
• Hydrofobe og hydrofile egenskaber
• Lipider og proteiner i membraner

Litteratur

• Kirpekar & Pedersen: Biomolecular chemistry, (2nd Ed., Pearson 2006). (kan købes i Studenterboghandelen). .

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
(a) Godkendelse af laboratorieresultater, bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser; laboratorieøvelserne vægtes med 1 ECTS ud af kursets 5 ECTS.
(b) 3 timers skriftlig eksamen med skriftlige hjælpemidler og lommeregner, 7-skala, ekstern censur.
(c) Reeksamen efter 4. kvartal.

Eksamensdato
Den ordinære eksamen finder sted den 3. april 2009
Reeksamen finder sted den 19. juni 2009

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatorisk laboratorieøvelser (12 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. February 2008 til 31. January 2010.