2013 Efterår 2012 Efterår 2011 Efterår 2010 Efterår 2009 Efterår 2008 Efterår 2007 Efterår
Se studieforløb hvor kurset indgår Se overgangsordninger
Dansk English

BMB506: Proteinkemi (5 ECTS)

STADS: 01008701

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: ihk@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
jonasb@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Tirsdag 08-10 U140 36-41,43-46
Fælles I Tirsdag 12-14 U110 48
Fælles I Torsdag 14-16 U140 36-37
S1 TE Onsdag 08-10 U130 38-41,43
S1 TL Onsdag 08-10 U10b 44-48
S2 TE Onsdag 12-14 U69a 38-41,43
S2 TL Onsdag 12-14 U10b 44-48
S3 TE Fredag 10-12 U142 38-41,43
S3 TL Fredag 10-12 U10b 44-48
S4 TE Tirsdag 10-12 U145 38-41,43
S4 TL Tirsdag 10-12 U10b 44-48
S5 TE Onsdag 14-16 U146 40
S5 TE Fredag 12-14 U142 38-39,41,43
S5 TL Fredag 12-14 U10b 44-48
S6 TE Tirsdag 14-16 U145 38-41,43
S6 TL Tirsdag 12-14 U10b 44
S6 TL Tirsdag 14-16 U10b 45-48
Vis hele skemaet
 Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Hold S4 er reserveret til studerende fra DTF.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Grundlæggende kemi (KE501) og Biologi - fra molekyle til økosystem (BB501) eller FF503 skal være bestået. Biomolekylær kemi (BMB501 eller BMB531) skal være kendt.

For TEK-studerende gælder kun bestået KE501 som indgangskrav. 

Kursusintroduktion
At give en grundig introduktion til proteiners struktur og funktioner og give en introduktion til, hvordan proteiner fungere i interaktion med andre biomolekyler i cellulære og fysiologiske sammenhænge.

Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

  • Relatere den kemiske struktur af de 20 aminosyrer og deres modifikationer til protiners struktur of funktion.Klassificerer primære, sekundære, tertiære og kvartenære struktur nivauer af proteiner.
  • Anvende programmet VMD til visualisering af proteiners tertiære struktur og anvende dette redskab til besvarelse af strukturelle problemstillinger.
  • Anvende programmet Cytoscape til visualisering af protein-protein interactionsdata
  • Beskrive proteiners foldning, misfoldning og nedbrydning i cellen og forstå hvordan fejl i disse systemer kan give anledning til konformationelle sygdomme.
  • Have kendskab til moderne proteinkemiske metoder til oprensning, karakterisering og bioinformatiske analyse af proteiner.
  • Beskrive hvordan proteiner fungere i interaktion med andre biomolekyler i cellulære og fysiologiske sammenhænge – herunder en forståelse af proteiners funktion i immun systemet, ved blod koagulation, samt i det sensoriske og motoriske system.
  • Foretage selvstændig søgning af litteratur og perspektivere problemstillinger indenfor et udvalgt proteinkemisk emne ved anvendelse af molekylærbiologiske tankegange, ræsonnementer og fagudtryk.
Emneoversigt
Proteinstruktur

  • Tertiær og kvaternær struktur
  • Strukturbestemmelse af proteiner ved NMR og røntgen diffraktion
  • Proteinmotiver og fold
  • Eksempler på proteinstrukturer

Proteinfoldning

  • Protein foldningsveje
  • Chaperoner
  • Dynamik
  • Strukturel evolution
  • Forudsigelse af proteinstrukturer
  • Konformationelle sygdomme

Struktur og funktion

  • Eksempler på struktur-funktions relationer
  • Proteinkomplekser
  • Proteintopologi og metoder til in vivo lokalisering af proteiner

Molekylær fysiologi:

  • Immun systemet
  • Mobilitet
  • Blodkoagulation

Posttranslatoriske modifikation af proteiner:

  • Phosphorylering
  • Glykosylering

Protein nedbrydning:

  • Proteaser involveret i protein turnover
  • Lysosomer
  • Ubiquitin-proteasom systemet

Metoder i proteinkemi:

  • Introduktion til proteomics
  • Introduktion til bioinformatik
  • Introduktion til protein engineering
Litteratur
  • Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko and Lubert Stryer: Biochemistry, 7th Edition.


Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
  1. Opgaver, der bedømmes samlet med bestået/ikke bestået med intern censur ved underviseren/instruktoren.
    Opgaverne skal være bestået, for at kunne indstille sig til eksamen.(01008712)
  2. Skriftlig eksamen baseret på tre-timers skriftlig eksamen med hjælpemidler uden net tilgang ved kursets afslutning. Extern censur med karakter efter 7-skalaen. Omfang 5 ECTS Reeksamen efter 2. kvartal.  (01008702)
Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (10 timer) og obligatoriske øvelser indenfor proteiners tertiære struktur ved brug af computer (5 x 2 timer).

(De angivne timetal er vejledende og der vil derfor kunne forekomme afvigelser).


Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Dette er den nyeste version af en kursusbeskrivelse, som trådte i kraft den 1. sep 2013.