BMB507: Fundamental mikrobiologi (5 ECTS)

STADS: 01002801

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
3. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: r.p.cox@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BB501 Biologi - fra molekyle til økosystem skal være bestået; BMB503 Fundamental biokemi og BMB504 Fundamental molekylær biologi forudsættes kendt. Kurset kan ikke tages af studerende, der har bestået BM115 eller BMB525.

Kursusintroduktion
Formål med faget er at introducere de studerende til mikroorganismers biologi og fungere som introduktion til specialiserede kurser indenfor emnet.

Kompetencer
De studerende vil opnå et fundamentalt kendskab til mikrobiologiens centrale emneområder så de kan
• beskrive celleopbygningen hos Bacteria og Archaea
• beskrive mikrobielle vækst såvel kvalitativt som kvantitativt
• beskrive de centrale metabolske processer i bakterieceller
• beskrive udvekslingen af genetisk materiale mellem bakterier
• diskutere aktuelle ideer om prokaryoters fylogeni og evolution
• diskutere den økologiske betydning af Bacteria og Archaea
• beskrive opbygningen af bakteriofager og deres interaktioner med bakterier
• anvende de væsentligste mikrobiologiske begreber

De studerende vil desuden opnå praktiske færdigheder i
• at undersøge mikroorganismer ved mikroskopi
• at arbejde i laboratoriet under anvendelse af sterile teknikker
• at anvende basale dyrkningsteknikker for mikroorganismer
• at anvende metoder til isolering og karakterisering af renkulturer.

Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• beskrive cellestruktur hos Bacteria og Archaea samt forklar den biologiske funktion af cellernes bestanddele
• beskrive en typisk vækstkurve for mikroorganismer og lave simpel beregninger pa grundlag af simpel teori for vækst i batchkultur og kontinuerlige kultur
• beskrive hvordan mikrooganismers vækst påvirkes af miljøfaktorer herunder temperatur, salt og pH.
• beskrive de væsentlige typer af energimetabolisme i mikrober, herunder fototrofi og kemolitotrofi
• beskrive de biokemiske reaktioner som indgå i inkorporering af C og N i nyt cellestof såvel hos autotrofer og hos heterotofer
• beskrive proteinsekretering og dannelsen af ekstracellulære strukturer hos bakterier
• beskrive udveksling af genetiske materiale mellem bakterieceller gennem transformering, transduktion samt conjugering
• diskutere hovedtræk i livets udviklingshistorie og beskrive karakteriske egnskaber hos de væsentligste grupper af Bacteria og Archaea
• beskrive bakteriers respons til miljøstress, herunder endosporedannelsen, motilitet samt "quorum sensing"
• beskrive de karakteriske egnskaber af en virus og beskrive virussers invasion af bakterieceller
• beskrive de kemiske reaktioner som indgår i biogeokemiske omdannelser af C, N og S i miljøet
• udføre laboratorieprocedurer som indgå i enumering af mikroroganismer samt isolering og karakterisering af renkulturer, samt afrapportere forsøgsresultater på en fagligt tilfredstillende mode
• forklare det optiske grundlag for fasekonstrastmikroskopi samt kunne anvende mikroskopet til observation af bakterieceller

Emneoversigt
1. Bakteriers cellestruktur
2. Bakteriers vækst og metabolisme.
3. Bakteriers genetik og evolution.
4. Bakteriers cellefysiologi.
5. Mikrobiel diversitet og økologi.
6. Bakteriofager og andre vira.
7. Mikrobiologisk laboratorieteknik

Litteratur

• M. Schaechter, J.L. Ingraham, F.C .Neidhardt:: Microbe,, ASM Press 2006.
• Øvelsesvejledning.

Pensum
Se pensumbeskrivelse.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
((a) Rapporter over laboratorieøvelser (bestået/ikke bestået, intern censur ved underviser)

(b) 3 timers skriftlig eksamen med alle hjælpemidler undtagen computer. Ekstern censur og karakter efter 7-trins -skala.

Reeksamen efter 4. kvartal.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 t) , eksaminatorier (8 t) samt laboratorieøvelser (15 t).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Bemærkninger
Dette kursus erstatter sammen med BMB510 Biomedicinsk mikrobiologi BM115 Mikrobiologi under det tidligere studieprogram. Kurset kan således ikke følges af studerende som har bestået BM115.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2009 til 31. januar 2010.