BMB526: Eksperimentel molekylærbiologi. Metoder til undersøgelse af eukaryot genregulering (10 ECTS)

STADS: 01003401

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
4. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: s.mandrup@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Max: 38 studerende

Intensivt kursus i de første 2½ uge af august.
Tilmeldes som forårskursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB503 Fundamental biokemi og BMB504 Fundamental molekylærbiologi skal være fulgt. Stoffet fra BM508 Avanceret molekylærbiologi forudsættes kendt.

Kursusintroduktion
1. At give de studerende en teoretisk indsigt i de molekylære processer, der ligger til grund for differentiering af eukaryote celler. I dette tilfælde benyttes fedtcelle (adipocyt)-differentiering.
2. At give de studerende en praktisk introduktion til gængse metoder der anvendes til analyse af genudtryk i pattedyrsceller.
3. Gennem en projektorienteret undervisningsform, at forberede de studerende på bachelor/ITEK/ specialeprojektet.

Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• Oprense RNA fra pattedyrsceller, lave cDNA og analysere gendutryk vha. real-time PCR.
• Lave nukleære protein-ekstrakter og anvende disse i electrophoretic mobility shift assays.
• Have kendskab til radioaktiv indmærkning af DNA oligoer
• Arbejde forsvarligt med 32-P mærkede (poly)-nukleotider
• Anvende SDS PAGE og western blotting til detektion af proteinudtryk
• Fortolke resultater opnået vha. ovenstående teknikker
• Planlægge forsøg hvor disse teknikker anvendes
• Have kendskab til signaltransduktion og genregulering under fedtcelleudvikling og kende til betydningen af fedtvævet i forbindelse med udvikling af insulin resistens.
Læse, forstå, fremlægge og diskutere original-artikler, der vedrørende eukaryot genregulering, herunder gør rede for de eksperimentelle teknikker der anvendes.

Emneoversigt
Teori:

Teoretisk introduktion til adipocyt differentiering med speciel fokus på transkriptionel regulering.
Fedtvævets rolle i forbindelse insulin resistens, type 2 diabetes og appetitregulering.

Teknikker:

Oprensning af RNA.
cDNA syntese
Real-time qPCR
Western blotting
Kromatin-immunopræcipitation
Transient transfektion
(Evt. andre teknikker efter samråd med de studerende)

Litteratur

• Øvelsesvejledning.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
a) Laboratorieøvelser, der bedømmes med B/IB og intern censur ved underviser.

b) Rapport, der bedømmes med B/IB og intern censur ved underviser. Kurset er ikke bestået, hvis rapporten ikke kan godkendes efter endelig aflevering den 1. november.

Evt. reeksamination finder sted ved den efterfølgende eksamenstermin i januar. Eksamensformen kan være en anden end rapport.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (30 timer) og laboratorieøvelser (70 timer). Intensivt kursus med lange dage (10-12 timer) må forventes nogle af dagene.
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Bemærkninger
Kurset afholdes de første 2½ uge af august. Kurset tilmeldes som forårskursus, men arbejdsbyrden ligger i august måned og i 1. kvartal af efterårssemesteret. Beregn 2-3 uger til at færdiggøre rapport efter kurset. I ugerne frem til rapportafleveringen holdes ugentlige dobbelttimer (4x2 timer) med hjælp til rapportskrivning og resultatbehandling. Deadline for aflevering af rapport til gennemlæsning og kommentering er 15. september, endelig aflevering 1. november.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2009 til 31. august 2009.