BMB529: Analytisk Proteinkemi (5 ECTS)

STADS: 01007301

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
4. kvartal

Ansvarlige undervisere
Email: php@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere
hjernoe@bmb.sdu.dk
lipen@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Max deltagere 12

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB506 Proteinkemi skal være fulgt

Kursusintroduktion
Formålet med kurset er at give de studerende en basal indføring i proteinkemiske teknikker som benyttes til karakterisering af proteiners primære struktur samt identifikation af proteiner

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
• Beskrive den primære struktur af et protein samt forklare principperne i de vigtigse metoder til primær analyse af proteinstruktur
• Forklare principperne i separation af polypeptider vha. HPLC
• Beskrive principperne i gel elektroforese
• Forklare principperne i aminosyreanalyse, og generel massespektrometri af polypeptider.
• Kunne integrere data fra aminosyreanalyse, HPLC og massespektrometri til løsning af proteiners primærstruktur
• Forklare princippet i et MALDI massespektrometer
• Forklare principperne i massespektrometrisk proteinidentifikation samt kunne analysere data herfra
• Forklare principperne i massespektrometrisk sekventering af peptider samt kunne analysere ms/ms data
• At kunne evaluere de i kurset anvendte teknikker til analyse af protein strukturer.
• At kunne benytte de i kurset anvendte programmer           

Emneoversigt
Følgende emner vil blive behandlet:
1. Proteiners primære struktur
2. Aminosyrernes kemiske egenskaber
3. Principperne i aminosyreanalyse  samt anvendelse til
 a) Protein/peptid karakterisering
 b) Kvantitering
4. Protein sekventering i form af
 a) Edman degradation
 b) Massespektrometrisk sekventering
5. SDS gelelektroforese af proteiner
6. Væskekromatografi
 a) Reverse phase til peptidseparation
 b) Ionbytning
 c) Solid phase extraction
7. Basal massespektrometri (MALDI)
 a) Intakt masse analyse
 b) Peptide mass fingerprinting
 c) MS/MS til identifikation
8. Bioinformatisk proteinanalyse  

Litteratur

• Øvelsesvejledning.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Projektopgave (5 ECTS), som afleveres 3 uger efter kursets afslutning og bedømmes med intern censur bestået/ikke bestået. (01007302)

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Undervisningen vil bestå af forelæsninger (10 timer), eksaminatorietimer/fremlæggelse (6 timer) og laboratorieøvelser/databehandling (40 timer)

(De angivne timetal er vejledende, der vil kunne forekomme afvigelser)
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Bemærkninger
Øvelsesrapport kan genafleveres inden for to uger efter rettelse

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2012 til 31. januar 2013.