BMB529: Analytisk Proteinkemi (5 ECTS)

STADS: 01007301

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
4. kvartal. Kurset afvikles i august måned.

Ansvarlige undervisere
Email: php@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
MAX 12 studerende.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB506 Proteinkemi - Bestået

Kursusintroduktion
Formålet med kurset er at give de studerende en indføring i basale proteinkemiske teknikker som benyttes til karakterisering afproteiners primære struktur samt identifikation af proteiner.

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:

• Beskrive den primære struktur af et protein samt forklare principperne i de vigtigse metoder til primær analyse af proteinstruktur
• Forklare principperne i separation af polypeptider vha. HPLC
• Beskrive principperne i gel elektroforese
• Forklare principperne i aminosyreanalyse, Edman degradation samt massespektrometri af polypeptider, kunne behandle data herfra samt integrere disse til løsning af protein primær struktur
• Forklare princippet i et MALDI massespektrometer
• Forklare principperne i massespektrometrisk proteinidentifikation samt kunne analysere data herfra
• Forklare principperne i massespektrometrisk sekventering af peptider samt kunne analysere ms/ms data
• At kunne evaluere de i kurset anvendte teknikker til analyse af protein strukturer.
• At kunne benytte de i kurset anvendte programmer

Emneoversigt
Følgende emner vil blive behandlet:
1. Proteiners primære struktur
2. Aminosyrernes kemiske egenskaber
3. Principperne i aminosyreanalyse  samt anvendelse til
 a) Protein/peptid karakterisering
 b) Kvantitering
4. Protein sekventering i form af
 a) Edman degradation
 b) Massespektrometrisk sekventering
5. SDS gelelektroforese af proteiner
6. Væskekromatografi
 a) Reverse phase til peptidseparation
 b) Ionbytning
 c) Solid phase extraction
7. Basal massespektrometri (MALDI)
 a) Intakt masse analyse
 b) Peptide mass fingerprinting
 c) MS/MS til identifikation
8. Bioinformatisk proteinanalyse

Litteratur

• Oplyses senere.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Projektopgave. Bestået/ikke bestået, intern censur. Øvelsesrapport afleveres 3 uger efter kursets afslutning.

Øvelsesrapport kan genafleveres inden for to uger efter rettelse

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsning, 8 timer
Eksaminatorier, 4 timer
Laboratorieøvelser, 35 timer

Det præcise forhold mellem undervisningsformer kan variere

 
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.

Bemærkninger
Øvelsesrapport kan genafleveres inden for to uger efter rettelse.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2013 til 31. januar 2015.