BMB826: Eksperimentel molekylærbiologi. Metoder til undersøgelse af eukaryot genregulering (10 ECTS)

STADS: 01011101

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: s.mandrup@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Mandag 08-19 Red Lab 31-33
Fælles I Mandag 08-19 U27 31-33
Fælles I Mandag 08-19 Red room 31-33
Fælles I Mandag 08-19 U26 31-33
Fælles I Tirsdag 08-19 U27 31-33
Fælles I Tirsdag 08-19 Red Lab 31-33
Fælles I Tirsdag 08-19 U26 31-33
Fælles I Tirsdag 08-19 Red room 31-33
Fælles I Onsdag 08-19 Red Lab 31-33
Fælles I Onsdag 08-19 U27 31-33
Fælles I Onsdag 08-19 Red room 31-33
Fælles I Onsdag 08-19 U26 31-33
Fælles I Torsdag 08-19 U27 31-33
Fælles I Torsdag 08-19 Red Lab 31-33
Fælles I Torsdag 08-19 Red room 31-33
Fælles I Torsdag 08-19 U26 31-33
Fælles I Fredag 08-19 Red room 31-33
Fælles I Fredag 08-19 U27 31-33
Fælles I Fredag 08-19 Red Lab 31-33
Fælles I Fredag 08-19 U26 31-33
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Undervisningen starter 1.august. Sammenlæses med BMB526 - Max 38 studerende.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Studerende, der følger kurset, forventes at:
  • Have kendskab til mekanismerne for regulering af eukaryot genregulering og metabolisme
  • Kunne anvende basale laboratorieteknikker
  • Have fulgt BMB532 og BMB533 samt have kendskab til stoffet fra BMB508 eller tilsvarende kursus


Formål
Kursets overordnede formål er at give den studerende grundigt praktisk og teoretisk kendskab til avancerede molekylærbiologiske teknikker samt sætte den studerende i stand til at planlægge og fortolke egne forsøg, hvilket er vigtigt i forhold til bachelorprojekt samt senere projektforløb.

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne BMB508 og BMB504, og giver et fagligt og kompetencemæssigt grundlag for efterfølgende projektforløb senere i uddannelsen.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give kompetence til selvstændig forsøgsplanlægning og fortolkning.
  • Give færdigheder i avancerede molekylærbiologiske metoder mundtlig fremstilling af resultater og artikler og sammenfatning af resultater i rapport på engelsk
  • Give viden om eukaryot genregulering, fedtcelleudvikling, fedtvævets fysiologiske betydning, den teoretiske baggrund for de anvendte molekylærbiologiske teknikker


Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
  • At give de studerende en teoretisk indsigt i de molekylære processer, der ligger til grund for differentiering af eukaryote celler. I dette tilfælde benyttes fedtcelle (adipocyt)-differentiering. 
  • At give de studerende en praktisk introduktion til gængse metoder der anvendes til analyse af genudtryk i pattedyrsceller.
  • Gennem en projektorienteret undervisningsform, at forberede de studerende på bachelor/ITEK/ specialeprojektet.
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Teoretisk introduktion til adipocyt differentiering med speciel fokus på transkriptionel regulering. 
  • Fedtvævets rolle i forbindelse insulin resistens, type 2 diabetes og appetitregulering. 
  • Introduktion til deep-sequencing og data genereret vha. ChIP-seq
  • Teoretisk og praktisk indføring i følgende teknikker:
    • Oprensning af RNA 
    • cDNA syntese
    • Real-time qPCR
    • Western blotting
    • Kromatin-immunopræcipitation
    • (Evt. andre teknikker efter samråd med de studerende)
Litteratur
  • Artikler noter som lægges på e-learn.


Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
  1. Mundtlig eksamen med udgangspunkt i en rapport baseret på laboratorieøvelser. Bedømmes med karakter ud fra 7-trinsskalaen ved intern censur. (10 ECTS). (01011102).

Reeksamen i samme termin eller umiddelbart derefter.



Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 10 timer
Træningsfase: 90 timer, heraf:
 - Eksaminatorie: 20 timer
 - Laboratorieøvelser: 70 timer

Aktiviteter i studiefasen

Undervisningsform
Aktiviteter i studiefasen:
  • Planlægning og fortolkning af egne forsøg 
  • Fremlæggelse af gruppens resultater
  • Udarbejdelse af rapport, gerne på engelsk

Kurset løber over 3 uger i begyndelsen af august med mødepligt alle dage. Den kan påregnes et intensivt forløb med lange dage men stort læringsudbytte.



Sprog
Dette kursus undervises på engelsk, hvis der deltager internationale studerende, ellers undervises på dansk.

Bemærkninger
Kurset har deltagerbegrænsning og hvis der er flere tilmeldte end begrænsningen angiver, prioriteres de rettidigt tilmeldte efter dato for tilmelding.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2016 til 31. august 2018.