BMB825: Bioimaging (5 ECTS)

STADS: 01011801

Niveau
Kandidatkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: brewer@memphys.sdu.dk

Yderligere undervisere
wuestner@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
MAX 12 studerende

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
En bacheloruddannelse i enten BMB, Nanobioscience eller Fysik og Kemi. Endvidere vil det  være en fordel for BMB-studerende at have fulgt og bestået kurset BMB509.

Kursusintroduktion
Bioimaging spiller en vigtig rolle i moderne biovidenskab, som et redskab til forskning, men også til at forbedre medicinske behandlinger og menneskeliv. Faget bioimaging indebærer teknikker til at udforske biologiske struktur og funktion, og visualisere / analysere disse oplysninger i tre og fire dimensioner. På dette kursus vil den studerende blive introduceret til de grundlæggende principper for optisk bioimaging samt til avancerede state-of-the-art teknikker. Kurset vil introducere den teoretiske baggrund, men er fokuseret på hands-on eksperimenter i laboratoriet. De studerende vil blive introduceret til mange forskellige optiske bioimaging teknikker og vil få de nødvendige redskaber til at lave præcis kvantitativ bioimaging. De vil også blive undervist i styrkerne og begrænsningerne af de forskellige teknikker. Kurset vil således samlet give de studerende en værktøjskasse til selvstændigt at anvende relevante optiske bioimaging teknikker.

Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:

• Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur
• Præsentere videnskabelige resultater i et mundtligt seminar på engelsk
• Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi
• Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
• Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering

Emneoversigt
Grundlæggende teori (herunder kvantitative billedanalyse) for de følgende teknikker vil blive gennemgået: 1) Laser Scanning Confocal Fluorescence microscopy 2) Spinning Disk Confocal Fluorescence microscopy 3) Widefield Fluorescence microscopy 4) Multiphoton Excitation Fluorescence microscopy 5) Second Harmonic Generation microscopy 6) Fluorescence Lifetime imaging  7) Super resolution techniques (STED microscopy) 8) Fluorescence Correlation spectroscopy og beslægtet tekniker (FCS, RICS)

Litteratur

Oplyses senere.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Mundtlig eksamen, karakter efter 7-trinsskalen, intern censur.
Laboratorieøvelser, bestået/ikke bestået, intern censur.

Øvrige bemærkninger:

1. I laboratorie øvelsen, vil de studerende blive delt i 4 grupper af 3 personer og arbejde i hold med fire forskellige øvelser (1 per gruppe). Hver gruppe skal rapportere og diskutere deres resultater til resten af klassen i et seminar. Denne aktivitet vil blive bedømt, bestået / ikke bestået bedømt af underviseren (1 ECTS); (01011812)
2. Mundtlig eksamen, der bedømmes efter 7-trinsskalaen og intern censur (4 ECTS).  (01011802)

Reeksamen vil finde sted senest 6 uger efter den ordinære eksamen.

 

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger, antal timer 24
Eksaminatorier/opgaveregning, antal timer 4
Laboratorieøvelser, antal timer 20
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på engelsk.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2015 til 31. januar 2017.