BMB506: Proteinkemi (5 ECTS)

STADS: 01000601

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
1. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: jens.andersen@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
Grundlæggende kemi (KE501) og Biologi - fra molekyle til økosystem (BB501) skal være bestået. Biomolekylær kemi (BMB501) skal være kendt.

Kursusintroduktion
At give en grundig introduktion til proteiners struktur og funktioner og give en introduktion til, hvordan proteiner fungere i interaktion med andre biomolekyler i cellulære og fysiologiske sammenhænge.

Kompetencer
• Have et grundigt kendskab til sammenhænget mellem proteiners struktur om funktion
• Have et kendskab til proteiners strukturelementer, hvordan disse er opstået evolutionelt, hvordan de foldes og misfoldes og hvordan deres struktur bestemmes eksperimentelt
• Have kendskab til hvor og hvordan proteiner lokaliserer i en celle og interagerer med andre biomolekyler og danner proteinkomplekser
• Have kendskab til hvordan proteiner virker i en større fysiologisk sammenhæng med udgangspunkt i komplekse systemer såsom immunsystemet
• Have kendskab til moderne metoder til studiet af proteiner – herunder bioinformatik og proteomics
• Kunne anvende visualiseringsredskaber til proteiners rumlige struktur
• Have forståelse af hvordan struktur-funktionsrelationer kan udnyttes i udvikling af medicin rettet mod proteiner

Forventet læringsudbytte


Emneoversigt
Proteinstruktur
• Tertiær og kvaternær struktur
• Strukturbestemmelse af proteiner ved NMR og røntgen diffraktion
• Proteinmotiver og fold
• Eksempler på proteinstrukturer

Proteinfoldning
• Protein foldningsveje
• Chaperoner
• Dynamik
• Strukturel evolution
• Forudsigelse af proteinstrukturer
• Konformationelle sygdomme

Struktur og funktion
• Eksempler på struktur-funktions relationer
• Proteinkomplekser
• Proteintopologi og metoder til in vivo lokalisering af proteiner

Molekylær fysiologi :
• Immun systemet
• Mobilitet
• Blodkoagulation

Posttranslatoriske modifikation af proteiner:
• Phosphorylering
• Glykosylering

Protein nedbrydning:
• Proteaser involveret i protein turnover
• Lysosomer
• Ubiquitin-proteasom systemet

Metoder i proteinkemi:
• Introduktion til proteomics
• Introduktion til bioinformatik
• Introduktion til protein engineering


Litteratur

• Berg, Tymoczko & Stryer: Biochemistry, 6th edition, Freeman, 2006.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Afløsningsopgave med mundtlig eksamination (gruppeeksamen med individuel vurdering). Ekstern censur og karakter efter 7-skalaen. Regneopgaverne skal være bestået for at kunne indstille sig til eksamen. Afløsningsopgaven udarbejdes i grupper på 3 personer.
Regneopgaverne bedømmes bestået/ikke bestået med intern censur ved underviseren.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (24 timer), eksaminatorier (12 timer) og obligatoriske regneøvelser indenfor proteiners tertiære struktur ved brug af computer (4 x 2 timer).
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Der er ikke registreret nogle oplysninger om undervisningssproget.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2006 til 31. august 2009.