2024 Efterår 2023 Efterår 2022 Efterår 2021 Efterår 2020 Efterår 2019 Efterår 2018 Efterår 2017 Efterår 2016 Efterår 2015 Efterår 2014 Efterår 2013 Efterår 2012 Efterår 2011 Efterår 2010 Efterår 2009 Efterår 2009 Forår 2008 Forår
Se studieforløb hvor kurset indgår Se overgangsordninger
Dansk English

BMB526: Eksperimentel molekylærbiologi. Metoder til undersøgelse af eukaryot genregulering (10 ECTS)

STADS: 01004801

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.

Ansvarlige undervisere
Email: s.mandrup@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Hold Type Dag Tidsrum Lokale Uger Kommentar
Fælles I Mandag 08-19 Green room 32
Fælles I Mandag 08-19 Red Lab 32-33
Fælles I Mandag 08-19 Red room 32-33
Fælles I Tirsdag 08-19 Red room 32-33
Fælles I Tirsdag 08-19 Green room 32
Fælles I Tirsdag 08-19 Red Lab 32-33
Fælles I Onsdag 08-19 Red room 32-33
Fælles I Onsdag 08-19 Red Lab 32-33
Fælles I Torsdag 08-19 Red Lab 32-33
Fælles I Torsdag 08-19 Red room 32-33
Fælles I Fredag 08-19 Red Lab 32-33
Fælles I Fredag 08-19 Red room 32-33
Vis hele skemaet
 Vis personligt skema for dette kursus.

Kommentar:
Undervisningen starter onsdag den 29. juli. Sammenlæses med BMB826 - Max 38 studerende.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB503 Fundamental biokemi og BMB504 Fundamental molekylærbiologi eller BMB532 Fundamental biokemi og BMB504 Fundamental molekylærbiologi skal være fulgt. Stoffet fra BM508 Avanceret molekylærbiologi forudsættes kendt.

Kursusintroduktion
  1. At give de studerende en teoretisk indsigt i de molekylære processer, der ligger til grund for differentiering af eukaryote celler. I dette tilfælde benyttes fedtcelle (adipocyt)-differentiering.
  2. At give de studerende en praktisk introduktion til gængse metoder der anvendes til analyse af genudtryk i pattedyrsceller.
  3. Gennem en projektorienteret undervisningsform, at forberede de studerende på bachelor/ITEK/ specialeprojektet.


Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

  • Oprense RNA fra pattedyrsceller, lave cDNA og analysere gendutryk vha. real-time PCR.
  • Anvende SDS PAGE og western blotting til detektion af proteinudtryk
  • Analysere binding af transkriptionsfaktorer til kromatin vha. kromatin-immupræcipitation (ChIP-PCR).
  • Fortolke resultater opnået vha. ovenstående teknikker
  • Planlægge forsøg hvor disse teknikker anvendes
  • Få kendskab til data baseret på ChIP kombineret med deep-sequencing (ChIP-seq) og anvende data i planlægning af egne forsøg
  • Have kendskab til signaltransduktion og genregulering under fedtcelleudvikling og kende til betydningen af fedtvævet i forbindelse med udvikling af insulin resistens.
  • Læse, forstå, fremlægge og diskutere original-artikler, der vedrørende eukaryot genregulering, herunder gør rede for de eksperimentelle teknikker der anvendes.
Emneoversigt
Teori:

Teoretisk introduktion til adipocyt differentiering med speciel fokus på transkriptionel regulering.
Fedtvævets rolle i forbindelse insulin resistens, type 2 diabetes og appetitregulering.
Introduktion til deep-sequencing, bioinformatik og data genereret vha. ChIP-seq.

Teknikker:

Oprensning af RNA.
cDNA syntese
Real-time qPCR
Western blotting
Kromatin-immunopræcipitation (ChIP)
(Evt. andre teknikker efter samråd med de studerende)

Litteratur
    Artikler noter som lægges på e-learn


Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
Rapport baseret på laboratorieøvelser, der bedømmes med bestået/ikke bestået og intern censur ved underviser. (01004802)
Kurset er ikke bestået, hvis rapporten ikke kan godkendes efter endelig aflevering den 1. november.

Reeksamen i samme termin eller umiddelbart derefter. Reeksamen afholdes som mundtlig eksamen.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 30 timer
Træningsfase: 70 timer, heraf:
 - Laboratorieøvelser: 70 timer

Aktiviteter i studiefasen
Undervisningen starter i uge 31. Max 36 studerende.

Undervisningen løber fra kl. 8.00 - 18.00 og må betragtes som meget intensiv i de uger, kurset forløber.

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Bemærkninger
Kurset afholdes de første 3 uger af august. Beregn 2-3 uger til at færdiggøre rapport efter kurset. I ugerne frem til rapportafleveringen holdes ugentlige dobbelttimer (4x2 timer) med hjælp til rapportskrivning og resultatbehandling. Deadline for aflevering af rapport til gennemlæsning og kommentering er 15. september, endelig aflevering 1. november.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. september 2015 til 31. august 2016.