BMB526: Eksperimentel molekylærbiologi. Metoder til undersøgelse af eukaryot genregulering (10 ECTS)

STADS: 01003401

Niveau
Bachelorkursus

Undervisningsperiode
Kurset er placeret i forårssemesteret.
4. kvartal.

Ansvarlige undervisere
Email: s.mandrup@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger
Vis hele skemaet
Vis personligt skema for dette kursus.

Skemaændringer:
: Ændring af lokaler.
: Uge 31 (onsdag til fredag)tilføjet i skemaet.

Kommentar:
Max: 38 studerende
Intensivt kursus i de første 2½ uge af august. Tilmeldes som forårskursus.

Indgangskrav:
Ingen

Faglige forudsætninger:
BMB503 Fundamental biokemi og BMB504 Fundamental molekylærbiologi skal være fulgt. Stoffet fra BM508 Avanceret molekylærbiologi forudsættes kendt.

Kursusintroduktion
1. At give de studerende en teoretisk indsigt i de molekylære processer, der ligger til grund for differentiering af eukaryote celler. I dette tilfælde benyttes fedtcelle (adipocyt)-differentiering.
2. At give de studerende en praktisk introduktion til gængse metoder der anvendes til analyse af genudtryk i pattedyrsceller.
3. Gennem en projektorienteret undervisningsform, at forberede de studerende på bachelor/ITEK/ specialeprojektet.

Forventet læringsudbytte
Når kurset er færdigt forventes den studerende at kunne:

• Oprense RNA fra pattedyrsceller, lave cDNA og analysere gendutryk vha. real-time PCR.
• Lave nukleære protein-ekstrakter og anvende disse i electrophoretic mobility shift assays.
• Have kendskab til radioaktiv indmærkning af DNA oligoer
• Arbejde forsvarligt med 32-P mærkede (poly)-nukleotider
• Anvende SDS PAGE og western blotting til detektion af proteinudtryk
• Fortolke resultater opnået vha. ovenstående teknikker
• Planlægge forsøg hvor disse teknikker anvendes
• Have kendskab til signaltransduktion og genregulering under fedtcelleudvikling og kende til betydningen af fedtvævet i forbindelse med udvikling af insulin resistens.
Læse, forstå, fremlægge og diskutere original-artikler, der vedrørende eukaryot genregulering, herunder gør rede for de eksperimentelle teknikker der anvendes.

Emneoversigt
Teori:

Teoretisk introduktion til adipocyt differentiering med speciel fokus på transkriptionel regulering.
Fedtvævets rolle i forbindelse insulin resistens, type 2 diabetes og appetitregulering.

Teknikker:

Oprensning af RNA.
cDNA syntese
Real-time qPCR
Ekstraktion af nukleare proteiner
Radioaktiv indmærkning af DNA oligoer
Electrophoretic mobility shift assay
(Evt. andre teknikker efter samråd med de studerende)

Litteratur

• Øvelsesvejledning.

Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).

Forudsætningsprøver
Ingen

Eksamen- og censurform:
a) Projektopgave, der bedømmes med B/IB og intern censur ved underviser.
b) Laboratorieøvelser, der bedømmes med B/IB og intern censur ved underviser.

Vejledende timetal
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

Forelæsninger (30 timer) og laboratorieøvelser (70 timer). Intensivt kursus med lange dage (10-12 timer) må forventes nogle af dagene.
Aktiviteter i studiefasen

Sprog
Dette kursus undervises på dansk.

Bemærkninger
Kurset afholdes de første 2½ uge af august. Kurset tilmeldes som forårskursus. Deadline for aflevering af rapport er sædvanligvis 1. oktober. Beregn 1-2 til at færdiggøre rapport efter kurset.

Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.

Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.

Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2008 til 31. januar 2009.